More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1517 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  56.24 
 
 
632 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
624 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.53 
 
 
627 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  56.73 
 
 
638 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  59.61 
 
 
687 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  59.03 
 
 
641 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  56.37 
 
 
622 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  58.54 
 
 
642 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  70.08 
 
 
634 aa  851    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  73.25 
 
 
632 aa  855    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  100 
 
 
624 aa  1228    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  58.16 
 
 
648 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  74.23 
 
 
635 aa  853    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  59.55 
 
 
636 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  60.26 
 
 
631 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  55.37 
 
 
658 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  55.91 
 
 
639 aa  631  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  55.97 
 
 
642 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  54.52 
 
 
658 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.37 
 
 
622 aa  621  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  55.09 
 
 
638 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
640 aa  621  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
622 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  55.52 
 
 
628 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  56.31 
 
 
627 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  54.8 
 
 
627 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
640 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  52.66 
 
 
626 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  53.46 
 
 
654 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  52.4 
 
 
627 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  52.4 
 
 
627 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  55.65 
 
 
648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  55.8 
 
 
620 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  54.52 
 
 
638 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  51.96 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.52 
 
 
614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.35 
 
 
631 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  52.48 
 
 
637 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 
663 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  52.01 
 
 
659 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  53.59 
 
 
632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.14 
 
 
628 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  42.74 
 
 
648 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  43.64 
 
 
626 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  41.41 
 
 
593 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  43.14 
 
 
594 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  41.9 
 
 
635 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.2 
 
 
611 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.22 
 
 
671 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
623 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  39.86 
 
 
589 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  43.22 
 
 
613 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
598 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.49 
 
 
613 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.5 
 
 
601 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.51 
 
 
626 aa  365  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  39.23 
 
 
607 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.17 
 
 
597 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.5 
 
 
586 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 
586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.17 
 
 
579 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
586 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.49 
 
 
602 aa  342  9e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.28 
 
 
586 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.17 
 
 
586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.17 
 
 
586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.89 
 
 
586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.17 
 
 
586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.17 
 
 
586 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.17 
 
 
586 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.33 
 
 
577 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.17 
 
 
571 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.83 
 
 
571 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.83 
 
 
571 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 
571 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.5 
 
 
571 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.67 
 
 
571 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 
571 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  36.97 
 
 
594 aa  334  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.96 
 
 
600 aa  334  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 
571 aa  334  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.67 
 
 
571 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.69 
 
 
598 aa  330  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.55 
 
 
582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.41 
 
 
587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.7 
 
 
597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.71 
 
 
600 aa  327  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.83 
 
 
585 aa  327  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.33 
 
 
571 aa  327  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.36 
 
 
582 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.74 
 
 
586 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  36.99 
 
 
632 aa  325  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.22 
 
 
598 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  35.41 
 
 
593 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.83 
 
 
627 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>