More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3071 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  61.76 
 
 		 631 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  58.7 
 
 		 627 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  63.22 
 
 		 627 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 622 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  61.87 
 
 		 640 aa  707    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  57.12 
 
 		 622 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 624 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.68 
 
 		 634 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  61.23 
 
 		 641 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  61.53 
 
 		 648 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  61.15 
 
 		 627 aa  703    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  59.54 
 
 		 632 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  66.99 
 
 		 640 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  59.08 
 
 		 638 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  62.68 
 
 		 638 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  61.32 
 
 		 632 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  59.2 
 
 		 637 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  63.35 
 
 		 642 aa  759    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  60.06 
 
 		 648 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  55.66 
 
 		 631 aa  636    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  58.43 
 
 		 627 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  56.46 
 
 		 639 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  61.15 
 
 		 627 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  61.53 
 
 		 663 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  95.21 
 
 		 658 aa  1187    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  61.33 
 
 		 654 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 628 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  61.76 
 
 		 626 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  60.77 
 
 		 659 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.98 
 
 		 614 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  61.45 
 
 		 636 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  100 
 
 		 658 aa  1299    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  61.91 
 
 		 637 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  68.69 
 
 		 632 aa  836    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  63.43 
 
 		 622 aa  762    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  67.37 
 
 		 642 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  58.74 
 
 		 620 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  61.61 
 
 		 687 aa  746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  53.92 
 
 		 638 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  54.52 
 
 		 624 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  47.84 
 
 		 628 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  44.15 
 
 		 648 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  46.3 
 
 		 626 aa  514  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 623 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  42.35 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  42.88 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.7 
 
 		 671 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  42.41 
 
 		 607 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  41.28 
 
 		 635 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.6 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  39.73 
 
 		 589 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.57 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.92 
 
 		 601 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.45 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.23 
 
 		 586 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.23 
 
 		 586 aa  363  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.73 
 
 		 586 aa  359  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.2 
 
 		 608 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.06 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.23 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.06 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.68 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.68 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.53 
 
 		 585 aa  355  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.27 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.27 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.45 
 
 		 617 aa  353  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.26 
 
 		 597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.26 
 
 		 597 aa  353  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  353  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.1 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.63 
 
 		 577 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 571 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.1 
 
 		 571 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 600 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.83 
 
 		 578 aa  349  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.83 
 
 		 578 aa  349  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.1 
 
 		 571 aa  349  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 571 aa  349  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.63 
 
 		 614 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  39.06 
 
 		 665 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 		 578 aa  345  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.36 
 
 		 572 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.71 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.72 
 
 		 641 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  38.49 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  35.41 
 
 		 580 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.68 
 
 		 597 aa  340  5e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.16 
 
 		 609 aa  339  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>