More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1954 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1217    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  62.39 
 
 		 571 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  62.57 
 
 		 571 aa  746    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  62.74 
 
 		 571 aa  750    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  62.74 
 
 		 571 aa  750    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  64.21 
 
 		 572 aa  773    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  94.5 
 
 		 582 aa  1092    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  94.33 
 
 		 582 aa  1093    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  64.76 
 
 		 576 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  64.21 
 
 		 572 aa  774    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  64.69 
 
 		 572 aa  786    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  70.77 
 
 		 567 aa  810    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  62.57 
 
 		 571 aa  746    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  71.48 
 
 		 568 aa  833    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.74 
 
 		 571 aa  750    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.74 
 
 		 571 aa  749    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.57 
 
 		 571 aa  751    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.21 
 
 		 572 aa  773    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  65.85 
 
 		 572 aa  796    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  62.04 
 
 		 571 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  71.88 
 
 		 584 aa  827    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  82.47 
 
 		 582 aa  934    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  68.09 
 
 		 565 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  71.63 
 
 		 566 aa  809    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.57 
 
 		 571 aa  748    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  70.95 
 
 		 567 aa  811    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.6 
 
 		 567 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  53.68 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  45.1 
 
 		 579 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  45.22 
 
 		 580 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  43.36 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  44.93 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  44.52 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.03 
 
 		 596 aa  498  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  48.17 
 
 		 575 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  47.34 
 
 		 612 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  42.15 
 
 		 615 aa  462  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  48.26 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  40.82 
 
 		 589 aa  438  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.91 
 
 		 597 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 577 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.61 
 
 		 577 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 598 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.58 
 
 		 597 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.7 
 
 		 591 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.31 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  36.76 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.01 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.47 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.38 
 
 		 578 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.38 
 
 		 578 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  36.7 
 
 		 598 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  37.21 
 
 		 602 aa  359  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  39.41 
 
 		 588 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.98 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.59 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 596 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.66 
 
 		 586 aa  357  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.15 
 
 		 586 aa  357  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.49 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.49 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  36.89 
 
 		 644 aa  356  7.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 733 aa  355  8.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  37.45 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.15 
 
 		 586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  36.58 
 
 		 601 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.32 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.32 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.88 
 
 		 617 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  36.41 
 
 		 601 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.61 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.36 
 
 		 601 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.36 
 
 		 606 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  36.95 
 
 		 603 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  37.71 
 
 		 606 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 594 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  36.49 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.28 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.22 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  38.16 
 
 		 575 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.84 
 
 		 601 aa  347  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.15 
 
 		 598 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 598 aa  346  7e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  37.4 
 
 		 671 aa  346  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.3 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.82 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.49 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.32 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  40.08 
 
 		 666 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.78 
 
 		 631 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  38.73 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.73 
 
 		 556 aa  343  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  39.66 
 
 		 652 aa  343  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.3 
 
 		 598 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>