More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4200 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.57 
 
 		 571 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.76 
 
 		 567 aa  880    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  59.57 
 
 		 571 aa  701    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  71.63 
 
 		 610 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  59.75 
 
 		 571 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  71.63 
 
 		 582 aa  810    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  59.75 
 
 		 571 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.75 
 
 		 571 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.7 
 
 		 572 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.7 
 
 		 572 aa  728    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  78.23 
 
 		 567 aa  892    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.75 
 
 		 571 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  70.04 
 
 		 582 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  62.41 
 
 		 572 aa  748    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.57 
 
 		 571 aa  701    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  65.43 
 
 		 568 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.75 
 
 		 571 aa  705    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  71.45 
 
 		 582 aa  808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  63.89 
 
 		 584 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.93 
 
 		 571 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  61.7 
 
 		 572 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  59.57 
 
 		 571 aa  703    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  77.35 
 
 		 565 aa  849    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  100 
 
 		 566 aa  1123    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  60.11 
 
 		 576 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  78.41 
 
 		 567 aa  893    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  62.59 
 
 		 572 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  51.68 
 
 		 572 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  42.73 
 
 		 580 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  44.73 
 
 		 636 aa  487  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.07 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  40.6 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  41.06 
 
 		 579 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  41.62 
 
 		 582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  42.93 
 
 		 615 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  45.07 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  44.89 
 
 		 612 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  46.68 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  37.67 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  38.16 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.64 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.23 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 575 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 598 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.72 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  40.34 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.92 
 
 		 598 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  38.12 
 
 		 597 aa  360  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.19 
 
 		 578 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.42 
 
 		 588 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.19 
 
 		 578 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.16 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.89 
 
 		 575 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.46 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.13 
 
 		 583 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  35.24 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.54 
 
 		 584 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  37.22 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.57 
 
 		 556 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.23 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.96 
 
 		 601 aa  346  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.46 
 
 		 606 aa  346  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  43.47 
 
 		 611 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.04 
 
 		 591 aa  345  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  43.47 
 
 		 611 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  38.03 
 
 		 671 aa  342  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.23 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 650 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  42.52 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.12 
 
 		 578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  41.92 
 
 		 611 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  36.13 
 
 		 601 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.84 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  35.95 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.96 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  36.65 
 
 		 618 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  41 
 
 		 647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  40.45 
 
 		 649 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.21 
 
 		 601 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 		 586 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  40.99 
 
 		 610 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  38.32 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.99 
 
 		 609 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  38.14 
 
 		 644 aa  333  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.33 
 
 		 590 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 		 586 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.43 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.49 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  36.76 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  37.74 
 
 		 578 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.86 
 
 		 608 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  38.86 
 
 		 672 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.32 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  40.91 
 
 		 655 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>