More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1991 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1991  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 611 aa  1217    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0980803  normal  0.606679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  43 
 
 		 625 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  42.83 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2435  ABC transporter, transmembrane region  45.76 
 
 		 600 aa  462  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.67 
 
 		 676 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  45.13 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  39.19 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.19 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  36.05 
 
 		 602 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.9 
 
 		 584 aa  327  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.7 
 
 		 587 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  36.69 
 
 		 618 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.67 
 
 		 611 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.33 
 
 		 582 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.78 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.91 
 
 		 597 aa  309  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.69 
 
 		 556 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.9 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  31.65 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.95 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  33.5 
 
 		 584 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.72 
 
 		 575 aa  296  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  30.51 
 
 		 571 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.48 
 
 		 594 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 		 609 aa  292  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.78 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  33.46 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  30.7 
 
 		 622 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.03 
 
 		 602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.89 
 
 		 618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.57 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.01 
 
 		 586 aa  289  9e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.34 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.42 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.04 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.34 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  29.98 
 
 		 609 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.17 
 
 		 586 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.25 
 
 		 585 aa  287  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.17 
 
 		 586 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.17 
 
 		 586 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.36 
 
 		 609 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.74 
 
 		 600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.01 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.36 
 
 		 608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.17 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.07 
 
 		 578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.59 
 
 		 594 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.07 
 
 		 578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.11 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.7 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  29.78 
 
 		 870 aa  280  4e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.9 
 
 		 628 aa  280  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  30.82 
 
 		 637 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 		 580 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.79 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.91 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.25 
 
 		 582 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.79 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.35 
 
 		 589 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.78 
 
 		 611 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  32.64 
 
 		 601 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  31.98 
 
 		 586 aa  277  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  31.22 
 
 		 632 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 		 611 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  30.84 
 
 		 624 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.31 
 
 		 627 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33.27 
 
 		 611 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.27 
 
 		 608 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.95 
 
 		 610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  33.28 
 
 		 600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  32.04 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.57 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.2 
 
 		 611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  32.76 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.47 
 
 		 608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.12 
 
 		 622 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  32.09 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  30.28 
 
 		 585 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.59 
 
 		 575 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.72 
 
 		 597 aa  273  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.1 
 
 		 609 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 600 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  32.11 
 
 		 701 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.03 
 
 		 597 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.2 
 
 		 592 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.64 
 
 		 632 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  31.31 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.2 
 
 		 619 aa  271  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 614 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.83 
 
 		 612 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  33.87 
 
 		 714 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  29.68 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>