More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2796 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  100 
 
 		 580 aa  1089    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.42 
 
 		 676 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2435  ABC transporter, transmembrane region  44.65 
 
 		 600 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1991  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  45.13 
 
 		 611 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0980803  normal  0.606679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  40.11 
 
 		 625 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  39.93 
 
 		 625 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.59 
 
 		 609 aa  320  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.59 
 
 		 610 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  34.57 
 
 		 584 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.21 
 
 		 584 aa  314  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  37.41 
 
 		 611 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  39.66 
 
 		 618 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.48 
 
 		 556 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.77 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.47 
 
 		 594 aa  290  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8971  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  33.65 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  35.61 
 
 		 602 aa  280  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.08 
 
 		 595 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.24 
 
 		 671 aa  280  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.32 
 
 		 580 aa  279  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 		 578 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.39 
 
 		 597 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.54 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.28 
 
 		 579 aa  277  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.08 
 
 		 627 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 585 aa  276  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.77 
 
 		 625 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.35 
 
 		 584 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 623 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.53 
 
 		 580 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.55 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.55 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.76 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.63 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.7 
 
 		 632 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.97 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  34.52 
 
 		 632 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.08 
 
 		 575 aa  270  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.03 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  33.94 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.09 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.95 
 
 		 580 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.49 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.49 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.5 
 
 		 608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.16 
 
 		 632 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.19 
 
 		 598 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.14 
 
 		 598 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.46 
 
 		 614 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  32.64 
 
 		 640 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.75 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.33 
 
 		 669 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  28 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  28.14 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.26 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.87 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.75 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.1 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.95 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.23 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.23 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.04 
 
 		 578 aa  264  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.86 
 
 		 627 aa  264  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.19 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.63 
 
 		 597 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.49 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.23 
 
 		 629 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.93 
 
 		 628 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.86 
 
 		 670 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.93 
 
 		 610 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.87 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.13 
 
 		 566 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  31.58 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.16 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  33.54 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.91 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  34.05 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  28.76 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  31.76 
 
 		 777 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  28.21 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  27.32 
 
 		 631 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 586 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.06 
 
 		 586 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.36 
 
 		 580 aa  260  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  39.13 
 
 		 589 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  32.82 
 
 		 575 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.72 
 
 		 582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.09 
 
 		 617 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  32.92 
 
 		 624 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>