More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2086 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  100 
 
 		 597 aa  1199    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  71.18 
 
 		 603 aa  815    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  50.59 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  50.78 
 
 		 614 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 601 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  46.21 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  43.91 
 
 		 598 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  43.71 
 
 		 601 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  43.3 
 
 		 600 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  42.71 
 
 		 598 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.16 
 
 		 605 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  42.88 
 
 		 597 aa  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.63 
 
 		 593 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 623 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.27 
 
 		 641 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.51 
 
 		 627 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.29 
 
 		 629 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.53 
 
 		 617 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.02 
 
 		 632 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.75 
 
 		 639 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.45 
 
 		 619 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.77 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.67 
 
 		 620 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.06 
 
 		 595 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.83 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.61 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.07 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.38 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.74 
 
 		 634 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.57 
 
 		 644 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.57 
 
 		 634 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.72 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.18 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.75 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.44 
 
 		 593 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.39 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  38.88 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.41 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.14 
 
 		 616 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.27 
 
 		 625 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.41 
 
 		 613 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.1 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.24 
 
 		 608 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.46 
 
 		 586 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.37 
 
 		 634 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36.8 
 
 		 586 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.97 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.46 
 
 		 599 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.07 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.8 
 
 		 600 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.46 
 
 		 681 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.5 
 
 		 601 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.44 
 
 		 617 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  37.48 
 
 		 606 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  38.15 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  37.69 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  42.29 
 
 		 581 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.14 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  38.54 
 
 		 616 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  38.63 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.54 
 
 		 608 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.23 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.08 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  38 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.23 
 
 		 603 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.32 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.86 
 
 		 622 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.85 
 
 		 590 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.27 
 
 		 589 aa  362  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 		 606 aa  362  9e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.34 
 
 		 580 aa  362  9e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.2 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  35.8 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.88 
 
 		 556 aa  362  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41 
 
 		 597 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.04 
 
 		 600 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.82 
 
 		 589 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.64 
 
 		 581 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 589 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.4 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.4 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  35.96 
 
 		 643 aa  357  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.19 
 
 		 585 aa  356  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  38.93 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.22 
 
 		 589 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.97 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  37.15 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 600 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.61 
 
 		 631 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.93 
 
 		 605 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 566 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.31 
 
 		 586 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.79 
 
 		 595 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  37.65 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0313  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.62 
 
 		 580 aa  351  2e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.532143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>