More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000242 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  76.08 
 
 
601 aa  915    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.39 
 
 
589 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  92.66 
 
 
586 aa  1097    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  100 
 
 
586 aa  1198    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  55.82 
 
 
589 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.71 
 
 
597 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.4 
 
 
605 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  55.03 
 
 
589 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.42 
 
 
587 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.42 
 
 
587 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  56.28 
 
 
588 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.74 
 
 
568 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.14 
 
 
600 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.59 
 
 
587 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.32 
 
 
590 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.49 
 
 
593 aa  568  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.66 
 
 
637 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.47 
 
 
580 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.31 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.21 
 
 
634 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4256  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  56.46 
 
 
588 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.96 
 
 
613 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.21 
 
 
634 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.21 
 
 
644 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.21 
 
 
644 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  49.04 
 
 
595 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.61 
 
 
613 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.39 
 
 
606 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.44 
 
 
618 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.44 
 
 
613 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.64 
 
 
617 aa  548  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.29 
 
 
582 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  47.11 
 
 
625 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  48.12 
 
 
650 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.82 
 
 
620 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.95 
 
 
600 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.83 
 
 
641 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.65 
 
 
632 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.63 
 
 
639 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  47.74 
 
 
606 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 
619 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.44 
 
 
597 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45 
 
 
608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  46.77 
 
 
593 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.39 
 
 
586 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.11 
 
 
627 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  47.58 
 
 
594 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.28 
 
 
628 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.98 
 
 
619 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  47.36 
 
 
611 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.98 
 
 
629 aa  505  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.63 
 
 
634 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.75 
 
 
603 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.52 
 
 
616 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.87 
 
 
600 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
601 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  45.67 
 
 
599 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  46.39 
 
 
616 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.96 
 
 
595 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.87 
 
 
600 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  46.53 
 
 
594 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.86 
 
 
608 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  45.5 
 
 
681 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.31 
 
 
590 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.69 
 
 
608 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
598 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 
586 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.5 
 
 
586 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.76 
 
 
597 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.9 
 
 
595 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.99 
 
 
614 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.33 
 
 
605 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  47.21 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.13 
 
 
600 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.91 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.71 
 
 
605 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  47.07 
 
 
602 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.06 
 
 
597 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.28 
 
 
631 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.06 
 
 
589 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.04 
 
 
618 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.77 
 
 
606 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.21 
 
 
618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  42.31 
 
 
597 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.55 
 
 
601 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.1 
 
 
616 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  42.5 
 
 
643 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  40.87 
 
 
598 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.61 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0888  ABC transporter related  45.63 
 
 
600 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0973  ABC transporter related  45.63 
 
 
600 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1279  ABC transporter-related protein  46.39 
 
 
612 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173874  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
601 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  39.14 
 
 
614 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  40.07 
 
 
603 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.11 
 
 
601 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  38.51 
 
 
581 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  37.85 
 
 
596 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.04 
 
 
581 aa  409  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>