More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0115 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  53.43 
 
 		 603 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 625 aa  1263    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  53.65 
 
 		 601 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  54.19 
 
 		 601 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  53.48 
 
 		 601 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  56.03 
 
 		 591 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  56.81 
 
 		 596 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  54.5 
 
 		 601 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  80.44 
 
 		 595 aa  946    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  54.61 
 
 		 602 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  51.9 
 
 		 596 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  51.72 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  52.96 
 
 		 619 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  51.79 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  51.81 
 
 		 596 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 620 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  52.63 
 
 		 590 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  50.51 
 
 		 590 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  52.11 
 
 		 590 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  51.93 
 
 		 590 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  46.37 
 
 		 595 aa  519  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 650 aa  468  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  41.99 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  46.11 
 
 		 644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  41.67 
 
 		 638 aa  450  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  42.35 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  40.07 
 
 		 651 aa  432  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 658 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 629 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.56 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 575 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 639 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  37.93 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  35.73 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 718 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  37.12 
 
 		 678 aa  364  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.73 
 
 		 588 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.88 
 
 		 580 aa  349  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  39.68 
 
 		 750 aa  349  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.85 
 
 		 597 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  34.01 
 
 		 645 aa  347  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  36.01 
 
 		 962 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.81 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.86 
 
 		 640 aa  343  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.18 
 
 		 571 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.83 
 
 		 571 aa  340  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.83 
 
 		 571 aa  340  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  340  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  340  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  339  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.83 
 
 		 571 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.85 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  34.34 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.91 
 
 		 572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 		 571 aa  336  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  33.33 
 
 		 610 aa  336  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.47 
 
 		 601 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.05 
 
 		 586 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.26 
 
 		 578 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.26 
 
 		 578 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.95 
 
 		 597 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.28 
 
 		 582 aa  332  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.42 
 
 		 567 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.28 
 
 		 582 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  37.32 
 
 		 770 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  33.61 
 
 		 636 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  37.32 
 
 		 750 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.43 
 
 		 617 aa  331  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.16 
 
 		 572 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.5 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 596 aa  330  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.82 
 
 		 584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  32.99 
 
 		 591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  32.25 
 
 		 613 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.42 
 
 		 764 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.33 
 
 		 1257 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.44 
 
 		 565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 636 aa  327  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  38.59 
 
 		 567 aa  327  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.31 
 
 		 572 aa  327  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.59 
 
 		 567 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.33 
 
 		 579 aa  326  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.69 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  38.74 
 
 		 468 aa  326  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.95 
 
 		 760 aa  326  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  34.13 
 
 		 777 aa  326  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  31.89 
 
 		 598 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.11 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.85 
 
 		 598 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.49 
 
 		 582 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.26 
 
 		 585 aa  324  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  31.72 
 
 		 576 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 581 aa  323  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  32.3 
 
 		 582 aa  323  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.54 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  36.98 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>