More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0913 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  54.17 
 
 
638 aa  717    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  62.37 
 
 
639 aa  801    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  51.44 
 
 
644 aa  654    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  51.75 
 
 
650 aa  665    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  59.97 
 
 
645 aa  736    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  52.78 
 
 
660 aa  666    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
629 aa  690    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  100 
 
 
678 aa  1363    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  51.72 
 
 
648 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  51.28 
 
 
658 aa  627  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  48.22 
 
 
651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
596 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  38.22 
 
 
591 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  36.66 
 
 
718 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  37.04 
 
 
602 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  35.83 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  35.67 
 
 
596 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  37.92 
 
 
601 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.29 
 
 
585 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  36.1 
 
 
596 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  37.12 
 
 
625 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  36.61 
 
 
603 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  34.71 
 
 
590 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  36.06 
 
 
601 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  36.22 
 
 
601 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  34.34 
 
 
590 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  36.69 
 
 
595 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  34.5 
 
 
590 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  34.18 
 
 
590 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  34.55 
 
 
596 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  37.66 
 
 
589 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
620 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
575 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  36.45 
 
 
619 aa  365  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  37.36 
 
 
588 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  35.35 
 
 
601 aa  360  5e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
598 aa  359  7e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.68 
 
 
617 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.58 
 
 
582 aa  350  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.67 
 
 
614 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.37 
 
 
702 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.08 
 
 
601 aa  347  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
620 aa  346  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.26 
 
 
608 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  35.98 
 
 
586 aa  343  7e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.79 
 
 
617 aa  341  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.17 
 
 
579 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.21 
 
 
606 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  35.82 
 
 
649 aa  340  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.58 
 
 
670 aa  340  7e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.69 
 
 
596 aa  339  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  35.7 
 
 
652 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
663 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.92 
 
 
598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.04 
 
 
556 aa  337  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.28 
 
 
601 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
598 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  36.51 
 
 
636 aa  335  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.57 
 
 
597 aa  334  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.74 
 
 
598 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.88 
 
 
594 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.88 
 
 
625 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  34.49 
 
 
666 aa  333  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.81 
 
 
581 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 
597 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  35.8 
 
 
468 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.23 
 
 
597 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.02 
 
 
607 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.62 
 
 
582 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  35.51 
 
 
606 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.89 
 
 
587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  33.55 
 
 
595 aa  330  7e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.68 
 
 
598 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  34.12 
 
 
598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  32.03 
 
 
680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.74 
 
 
721 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.51 
 
 
598 aa  328  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  35.34 
 
 
580 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  32.47 
 
 
695 aa  328  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.01 
 
 
620 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  33.75 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  33.75 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.31 
 
 
677 aa  327  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.33 
 
 
669 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
733 aa  327  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 
608 aa  327  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.75 
 
 
634 aa  326  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.33 
 
 
598 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
598 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
598 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.7 
 
 
632 aa  326  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  32.94 
 
 
619 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
571 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  34 
 
 
624 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  32.58 
 
 
691 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  34.48 
 
 
613 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 
622 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  33.28 
 
 
631 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  31.91 
 
 
636 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>