More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2187 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  54.47 
 
 
601 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  52.07 
 
 
596 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  55.42 
 
 
602 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  80.44 
 
 
625 aa  971    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  58.39 
 
 
596 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  55.87 
 
 
619 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  55.57 
 
 
601 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  57.31 
 
 
591 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  55 
 
 
603 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  54.97 
 
 
601 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  100 
 
 
595 aa  1198    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  51.02 
 
 
596 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  52.76 
 
 
596 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  54.81 
 
 
601 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  52.77 
 
 
596 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
620 aa  621  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  52.55 
 
 
590 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  51.49 
 
 
590 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  52.37 
 
 
590 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  52.37 
 
 
590 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  47.68 
 
 
595 aa  543  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
650 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  42.91 
 
 
660 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  44.05 
 
 
644 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  41.67 
 
 
638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  43.65 
 
 
648 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  44.36 
 
 
658 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  40.56 
 
 
651 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
629 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.88 
 
 
585 aa  412  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
575 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
639 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  38.7 
 
 
750 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
718 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  35.7 
 
 
579 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  37.39 
 
 
962 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  37.59 
 
 
589 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  34.66 
 
 
636 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  36.69 
 
 
678 aa  362  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.42 
 
 
580 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
598 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.02 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.85 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.85 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.85 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.85 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.85 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.68 
 
 
571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  34.89 
 
 
645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.88 
 
 
571 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.53 
 
 
588 aa  353  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 
571 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  35.54 
 
 
568 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.88 
 
 
571 aa  353  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.67 
 
 
597 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35 
 
 
578 aa  349  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35 
 
 
578 aa  349  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  35.31 
 
 
565 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.11 
 
 
640 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.07 
 
 
572 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.96 
 
 
586 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
572 aa  339  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.42 
 
 
578 aa  339  9e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 
596 aa  338  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.19 
 
 
597 aa  339  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  34.39 
 
 
615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.44 
 
 
556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.1 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.61 
 
 
594 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  35.14 
 
 
808 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  33.85 
 
 
610 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
581 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
636 aa  334  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  34.58 
 
 
777 aa  334  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  34.45 
 
 
770 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.74 
 
 
582 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.74 
 
 
582 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  34.12 
 
 
750 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.21 
 
 
587 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.54 
 
 
582 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.19 
 
 
468 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
591 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  34.63 
 
 
760 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.13 
 
 
576 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.77 
 
 
566 aa  329  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.66 
 
 
572 aa  329  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.87 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.91 
 
 
631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  35.66 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.66 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  37.73 
 
 
764 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.33 
 
 
608 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  37.14 
 
 
649 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.59 
 
 
575 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 
726 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.15 
 
 
601 aa  327  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.05 
 
 
593 aa  326  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.33 
 
 
598 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.17 
 
 
567 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.96 
 
 
768 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>