More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3017 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  51.99 
 
 
660 aa  637    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  61.75 
 
 
678 aa  786    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  53.41 
 
 
629 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  62.95 
 
 
645 aa  784    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  53.82 
 
 
638 aa  695    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  100 
 
 
639 aa  1286    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  52.72 
 
 
648 aa  626  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  50.47 
 
 
644 aa  618  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
650 aa  612  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  51.56 
 
 
658 aa  605  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  47.03 
 
 
651 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  40.03 
 
 
596 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  38.49 
 
 
591 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  37.68 
 
 
601 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  37.52 
 
 
601 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  37.58 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  37.62 
 
 
603 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
620 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
718 aa  412  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  38.1 
 
 
601 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  37.08 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  35.42 
 
 
590 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  38.05 
 
 
625 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  38.42 
 
 
585 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  35.81 
 
 
590 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  34.68 
 
 
590 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  35.33 
 
 
590 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  39.24 
 
 
595 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  35.49 
 
 
596 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  35.95 
 
 
596 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  35.23 
 
 
596 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1461  ABC transporter transmembrane region  78.4 
 
 
352 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  37.01 
 
 
619 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  37.68 
 
 
601 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  40.77 
 
 
649 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.09 
 
 
670 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
575 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 
598 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
598 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.83 
 
 
637 aa  369  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 
598 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.14 
 
 
702 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  35.59 
 
 
680 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  35.86 
 
 
691 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  34.5 
 
 
636 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 
598 aa  364  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.3 
 
 
614 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.87 
 
 
618 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.79 
 
 
598 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.44 
 
 
598 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.52 
 
 
618 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 
637 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.7 
 
 
617 aa  361  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  38.07 
 
 
589 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.26 
 
 
598 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.26 
 
 
598 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.26 
 
 
598 aa  360  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  34.44 
 
 
666 aa  359  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.42 
 
 
601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.12 
 
 
587 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.67 
 
 
677 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
605 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  35.89 
 
 
653 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.92 
 
 
597 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.92 
 
 
597 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  37.31 
 
 
652 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  37.12 
 
 
663 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.75 
 
 
671 aa  354  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.52 
 
 
598 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.65 
 
 
582 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.16 
 
 
597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  35.76 
 
 
765 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.92 
 
 
608 aa  353  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.76 
 
 
588 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  34.49 
 
 
669 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  33.72 
 
 
624 aa  350  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.08 
 
 
608 aa  349  8e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  33.88 
 
 
595 aa  348  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
620 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.71 
 
 
721 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
600 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
661 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 
634 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  37.6 
 
 
672 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  34.33 
 
 
663 aa  347  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.87 
 
 
571 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  38.82 
 
 
642 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.45 
 
 
625 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.06 
 
 
613 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  38.18 
 
 
640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.99 
 
 
598 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.5 
 
 
586 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  32.69 
 
 
626 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.34 
 
 
641 aa  343  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  33.97 
 
 
625 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.34 
 
 
601 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.95 
 
 
580 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  33.66 
 
 
582 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.15 
 
 
606 aa  339  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  35.68 
 
 
642 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>