More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  69.77 
 
 		 962 aa  834    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  100 
 
 		 750 aa  1457    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  42.47 
 
 		 603 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  40.77 
 
 		 602 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  40.24 
 
 		 601 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  39.8 
 
 		 601 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  39.73 
 
 		 596 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  39.63 
 
 		 601 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 596 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  40.85 
 
 		 591 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  37.67 
 
 		 596 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  37.52 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  35.36 
 
 		 590 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  35.27 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  35.26 
 
 		 590 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  37.44 
 
 		 596 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  39.77 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  34.75 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  39.43 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  38.7 
 
 		 595 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 620 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  36.75 
 
 		 625 aa  359  9e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  34.4 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  38.27 
 
 		 660 aa  342  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 650 aa  337  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  33.77 
 
 		 638 aa  330  6e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  36.69 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 658 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  34.43 
 
 		 651 aa  304  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  35.58 
 
 		 648 aa  297  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 639 aa  296  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 629 aa  293  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  35.48 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.77 
 
 		 571 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 571 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  36.99 
 
 		 468 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.58 
 
 		 576 aa  290  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.33 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.58 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.58 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.58 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.58 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.9 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.58 
 
 		 571 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  33.33 
 
 		 589 aa  286  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 566 aa  279  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.43 
 
 		 566 aa  277  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.6 
 
 		 579 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.02 
 
 		 572 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.64 
 
 		 556 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  43.16 
 
 		 606 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.19 
 
 		 582 aa  272  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  35.13 
 
 		 649 aa  272  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 598 aa  271  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.27 
 
 		 580 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 620 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.04 
 
 		 572 aa  270  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.33 
 
 		 584 aa  270  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.39 
 
 		 586 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.27 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.87 
 
 		 606 aa  268  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.86 
 
 		 572 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.57 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.57 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.86 
 
 		 572 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.75 
 
 		 586 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.26 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.87 
 
 		 596 aa  266  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  40.43 
 
 		 672 aa  266  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  32.68 
 
 		 646 aa  266  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  33.23 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.75 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.39 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.39 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  37.72 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.48 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 718 aa  265  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.64 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  36 
 
 		 777 aa  265  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.53 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  53.53 
 
 		 591 aa  264  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.39 
 
 		 586 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.86 
 
 		 578 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.86 
 
 		 578 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  33.46 
 
 		 594 aa  262  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  31.5 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.9 
 
 		 670 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  31.56 
 
 		 619 aa  261  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.03 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.54 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>