More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0338 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  100 
 
 
1194 aa  2425    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.93 
 
 
1228 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  29.67 
 
 
1138 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.17 
 
 
602 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  31.04 
 
 
1284 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  29.16 
 
 
1179 aa  353  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.46 
 
 
593 aa  350  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.61 
 
 
1179 aa  348  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.76 
 
 
604 aa  343  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  29.01 
 
 
1179 aa  341  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  29.01 
 
 
1179 aa  341  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.28 
 
 
619 aa  339  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.51 
 
 
1091 aa  334  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.69 
 
 
593 aa  332  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 
618 aa  330  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  30.69 
 
 
1231 aa  329  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.68 
 
 
584 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
599 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.76 
 
 
606 aa  327  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  39.09 
 
 
595 aa  326  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  27.26 
 
 
1218 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.88 
 
 
599 aa  320  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.1 
 
 
597 aa  319  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  27.09 
 
 
1218 aa  318  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  39.72 
 
 
598 aa  317  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 
597 aa  316  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.91 
 
 
611 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  29.89 
 
 
1230 aa  316  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
590 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.93 
 
 
589 aa  315  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.11 
 
 
583 aa  315  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.07 
 
 
576 aa  314  5.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.15 
 
 
580 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  27.12 
 
 
1218 aa  312  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48483  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  28.73 
 
 
1250 aa  310  6.999999999999999e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  27.11 
 
 
1218 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  26.9 
 
 
1218 aa  308  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  31.11 
 
 
592 aa  307  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.52 
 
 
590 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
590 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.68 
 
 
581 aa  305  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.28 
 
 
593 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.86 
 
 
1323 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  26.18 
 
 
1205 aa  303  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.75 
 
 
577 aa  302  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  30.57 
 
 
573 aa  301  5e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  33.9 
 
 
677 aa  301  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  28.72 
 
 
587 aa  301  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  28.72 
 
 
587 aa  301  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  30.46 
 
 
573 aa  299  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.2 
 
 
618 aa  299  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.03 
 
 
608 aa  299  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.42 
 
 
581 aa  294  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  33.51 
 
 
609 aa  292  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.64 
 
 
627 aa  292  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  34.44 
 
 
611 aa  292  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.06 
 
 
579 aa  290  8e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  38.97 
 
 
593 aa  289  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.51 
 
 
596 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.27 
 
 
588 aa  284  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.61 
 
 
583 aa  283  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31 
 
 
573 aa  283  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
578 aa  283  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  31.26 
 
 
596 aa  283  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.5 
 
 
1377 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.28 
 
 
609 aa  281  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.03 
 
 
588 aa  279  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.88 
 
 
574 aa  278  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.51 
 
 
575 aa  277  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.02 
 
 
993 aa  277  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  31.28 
 
 
576 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.93 
 
 
588 aa  275  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.5 
 
 
593 aa  275  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.92 
 
 
579 aa  274  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.43 
 
 
583 aa  274  9e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  29.31 
 
 
1332 aa  273  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.66 
 
 
600 aa  271  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  33.98 
 
 
596 aa  271  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  30.82 
 
 
611 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  31.38 
 
 
597 aa  270  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.98 
 
 
598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.14 
 
 
572 aa  265  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.85 
 
 
581 aa  265  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 
565 aa  265  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  33.16 
 
 
612 aa  264  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.02 
 
 
578 aa  264  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.22 
 
 
595 aa  263  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.02 
 
 
578 aa  264  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.21 
 
 
582 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.02 
 
 
578 aa  263  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.67 
 
 
577 aa  262  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  31.41 
 
 
603 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.37 
 
 
581 aa  261  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.95 
 
 
581 aa  261  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.91 
 
 
579 aa  261  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.39 
 
 
600 aa  261  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.51 
 
 
577 aa  259  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.16 
 
 
592 aa  259  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.69 
 
 
610 aa  259  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>