More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4532 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  100 
 
 
650 aa  1300    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  100 
 
 
650 aa  1300    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  82.2 
 
 
634 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  98.15 
 
 
641 aa  1239    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  82.37 
 
 
633 aa  1054    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  57.87 
 
 
595 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  57.53 
 
 
615 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  48.73 
 
 
612 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
604 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  52.6 
 
 
607 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  48.45 
 
 
631 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  51.52 
 
 
605 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  47.72 
 
 
589 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  44.65 
 
 
632 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  42.42 
 
 
602 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.2 
 
 
608 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
650 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.52 
 
 
612 aa  358  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
581 aa  352  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.25 
 
 
606 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.47 
 
 
578 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.47 
 
 
578 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.53 
 
 
601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.14 
 
 
1321 aa  326  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.28 
 
 
598 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.83 
 
 
1284 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.05 
 
 
588 aa  310  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 
573 aa  309  8e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.22 
 
 
586 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.88 
 
 
641 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.67 
 
 
1522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.17 
 
 
586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.9 
 
 
594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.17 
 
 
578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 
586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.04 
 
 
589 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.85 
 
 
581 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
1194 aa  300  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 
586 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.1 
 
 
614 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
628 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.17 
 
 
586 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
636 aa  296  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.3 
 
 
586 aa  296  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.83 
 
 
586 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.94 
 
 
589 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.8 
 
 
584 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.83 
 
 
586 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.04 
 
 
608 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.88 
 
 
556 aa  294  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.66 
 
 
586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.66 
 
 
586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
598 aa  293  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.25 
 
 
594 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.15 
 
 
1301 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.17 
 
 
597 aa  293  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.83 
 
 
586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.82 
 
 
588 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  33.16 
 
 
592 aa  292  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
607 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.62 
 
 
601 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.55 
 
 
597 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32 
 
 
593 aa  289  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  32.59 
 
 
660 aa  289  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 
571 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.84 
 
 
583 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.35 
 
 
598 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36 
 
 
642 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.22 
 
 
579 aa  287  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.13 
 
 
609 aa  287  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
658 aa  286  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.58 
 
 
602 aa  286  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.94 
 
 
644 aa  286  9e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.05 
 
 
634 aa  286  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.42 
 
 
592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.59 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.86 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.09 
 
 
773 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.13 
 
 
1436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.94 
 
 
585 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  31.13 
 
 
575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.8 
 
 
580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  32.51 
 
 
636 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  32.43 
 
 
764 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.88 
 
 
622 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.23 
 
 
760 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 
571 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.33 
 
 
587 aa  283  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  34.25 
 
 
577 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  30.38 
 
 
614 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.53 
 
 
575 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  32.57 
 
 
577 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.49 
 
 
594 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.19 
 
 
1257 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30.34 
 
 
581 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.78 
 
 
591 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.79 
 
 
617 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.98 
 
 
593 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>