More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1665 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  100 
 
 
632 aa  1245    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  58.37 
 
 
602 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  57.97 
 
 
596 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  60.4 
 
 
650 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.65 
 
 
608 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  48.8 
 
 
631 aa  515  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.67 
 
 
612 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  50.58 
 
 
589 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  44.65 
 
 
650 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  44.65 
 
 
650 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  44.84 
 
 
612 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
604 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  44.04 
 
 
641 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  43.49 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  46.03 
 
 
615 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
634 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  44.41 
 
 
595 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  46.47 
 
 
607 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  46.33 
 
 
605 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  63.58 
 
 
339 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.39 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.99 
 
 
601 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
598 aa  303  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.82 
 
 
584 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.35 
 
 
1522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.42 
 
 
606 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  31.02 
 
 
598 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.49 
 
 
577 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  33.55 
 
 
1321 aa  278  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.52 
 
 
1284 aa  274  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.27 
 
 
614 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  29.61 
 
 
578 aa  273  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.68 
 
 
573 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.4 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.84 
 
 
640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.2 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 
572 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.2 
 
 
572 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  34.31 
 
 
622 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 
571 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  36.81 
 
 
606 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3401  ABC transporter, transmembrane region  51.89 
 
 
277 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0637636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  35.35 
 
 
610 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.02 
 
 
585 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 
571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.22 
 
 
571 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.22 
 
 
571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.09 
 
 
572 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.52 
 
 
587 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.23 
 
 
588 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.7 
 
 
611 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  31.55 
 
 
592 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 
571 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  34.19 
 
 
587 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.22 
 
 
578 aa  267  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.22 
 
 
578 aa  267  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.17 
 
 
571 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.05 
 
 
571 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 
591 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.34 
 
 
556 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.34 
 
 
580 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.93 
 
 
618 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 
571 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.05 
 
 
585 aa  265  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.01 
 
 
577 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  34.35 
 
 
608 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.39 
 
 
589 aa  263  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.27 
 
 
610 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
571 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.1 
 
 
575 aa  263  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.9 
 
 
609 aa  263  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.69 
 
 
587 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.77 
 
 
597 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.05 
 
 
1257 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.77 
 
 
597 aa  262  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.09 
 
 
610 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.09 
 
 
610 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.03 
 
 
567 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
578 aa  261  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.35 
 
 
567 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  32.9 
 
 
611 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  29.83 
 
 
594 aa  260  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  30.9 
 
 
594 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.3 
 
 
580 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.58 
 
 
636 aa  259  9e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  35.85 
 
 
1436 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.57 
 
 
611 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  33.88 
 
 
577 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  32.45 
 
 
592 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.91 
 
 
582 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.73 
 
 
597 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.75 
 
 
611 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.12 
 
 
608 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.05 
 
 
586 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  33 
 
 
587 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.45 
 
 
586 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.44 
 
 
621 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  33.09 
 
 
605 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.47 
 
 
586 aa  257  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>