More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8741 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  68.59 
 
 		 577 aa  771    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  65.52 
 
 		 583 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  63.08 
 
 		 577 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  69.98 
 
 		 577 aa  822    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  76.08 
 
 		 577 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  65.05 
 
 		 577 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  60.63 
 
 		 578 aa  669    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  65.4 
 
 		 581 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  63.4 
 
 		 577 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  65.8 
 
 		 579 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  67.07 
 
 		 577 aa  776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  58.75 
 
 		 577 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  58.6 
 
 		 595 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  73.14 
 
 		 581 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  100 
 
 		 577 aa  1149    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  60.66 
 
 		 577 aa  693    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  60.18 
 
 		 577 aa  682    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.05 
 
 		 578 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  57.52 
 
 		 582 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  61.35 
 
 		 577 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  66.78 
 
 		 582 aa  777    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  66.96 
 
 		 578 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  58.6 
 
 		 595 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  58.6 
 
 		 594 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  58.6 
 
 		 595 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  65.34 
 
 		 577 aa  745    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  56.72 
 
 		 586 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.42 
 
 		 587 aa  664    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  73.83 
 
 		 577 aa  821    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 582 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  51.22 
 
 		 577 aa  616  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  57.17 
 
 		 584 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  61.97 
 
 		 584 aa  608  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  60.67 
 
 		 585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  52.24 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  44.43 
 
 		 574 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  49.82 
 
 		 575 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  49.21 
 
 		 575 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  43.7 
 
 		 584 aa  541  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  50.43 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  46.74 
 
 		 741 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  47.23 
 
 		 748 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  48.3 
 
 		 741 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  45.85 
 
 		 755 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.17 
 
 		 741 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  46.42 
 
 		 742 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.89 
 
 		 654 aa  492  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  47.28 
 
 		 755 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  45.77 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.64 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  46.45 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  41.19 
 
 		 575 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  43.72 
 
 		 580 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.32 
 
 		 719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  40.73 
 
 		 583 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.02 
 
 		 577 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.68 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  41.2 
 
 		 577 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  46.56 
 
 		 720 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  40 
 
 		 573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 593 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  39.34 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  40.28 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  40.28 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  44.05 
 
 		 586 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.28 
 
 		 583 aa  433  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  38.1 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.35 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.42 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  41.03 
 
 		 623 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.31 
 
 		 584 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  38.45 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.45 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.45 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.45 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  41.35 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.1 
 
 		 584 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.42 
 
 		 579 aa  412  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  39.96 
 
 		 578 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.92 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  38.45 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.79 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.74 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.39 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.49 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  38.4 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.63 
 
 		 652 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  38.62 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  39.58 
 
 		 575 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.41 
 
 		 580 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  36.63 
 
 		 589 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  36.98 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  35.96 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>