More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3402 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  100 
 
 		 339 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  83.19 
 
 		 602 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  63.58 
 
 		 632 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  60.66 
 
 		 608 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 596 aa  332  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  56.23 
 
 		 631 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 604 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  55.06 
 
 		 589 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  54.75 
 
 		 595 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  53.75 
 
 		 615 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.69 
 
 		 612 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 		 634 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  53.09 
 
 		 607 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  49.55 
 
 		 650 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  49.55 
 
 		 650 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  50.46 
 
 		 641 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  49.4 
 
 		 633 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  48.13 
 
 		 612 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  52.26 
 
 		 605 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  41.61 
 
 		 1522 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  42.12 
 
 		 581 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  42.77 
 
 		 1321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  40.52 
 
 		 584 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  40.85 
 
 		 578 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  42.38 
 
 		 586 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  45 
 
 		 581 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  39.13 
 
 		 593 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  38.34 
 
 		 581 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  42.72 
 
 		 1436 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  40.25 
 
 		 601 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  38.24 
 
 		 575 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  40.19 
 
 		 644 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  40.52 
 
 		 595 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  37.94 
 
 		 587 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.08 
 
 		 652 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.47 
 
 		 578 aa  227  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.81 
 
 		 1257 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.62 
 
 		 606 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  37.66 
 
 		 580 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  38.28 
 
 		 582 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 1194 aa  225  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  38.17 
 
 		 614 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.42 
 
 		 586 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.62 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  38.08 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 582 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.08 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.43 
 
 		 580 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  38.66 
 
 		 591 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.2 
 
 		 575 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  41.48 
 
 		 1284 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 		 594 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 586 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.54 
 
 		 578 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.54 
 
 		 578 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.13 
 
 		 598 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  37.75 
 
 		 586 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.75 
 
 		 586 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  36.89 
 
 		 633 aa  222  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 598 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 		 580 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.89 
 
 		 601 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.71 
 
 		 577 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.42 
 
 		 586 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  40.33 
 
 		 577 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  38.13 
 
 		 585 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.42 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.66 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  37.89 
 
 		 645 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  39.09 
 
 		 567 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.02 
 
 		 579 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.09 
 
 		 567 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  36.89 
 
 		 755 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  39.94 
 
 		 594 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.39 
 
 		 577 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.62 
 
 		 586 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  37.54 
 
 		 577 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  37.33 
 
 		 578 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  39.09 
 
 		 640 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  38.49 
 
 		 575 aa  218  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  37.16 
 
 		 660 aa  218  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  39.67 
 
 		 631 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  34.53 
 
 		 588 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  46.81 
 
 		 746 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  39.47 
 
 		 592 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  35.46 
 
 		 583 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  39.53 
 
 		 596 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  39.53 
 
 		 596 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  43.39 
 
 		 584 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.86 
 
 		 628 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  39.87 
 
 		 589 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 578 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  38.66 
 
 		 586 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 581 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  38.03 
 
 		 587 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  37.09 
 
 		 581 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  40.26 
 
 		 611 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.86 
 
 		 625 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 576 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>