More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0884 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  55.44 
 
 		 652 aa  664    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  55.67 
 
 		 582 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  60.95 
 
 		 583 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  100 
 
 		 633 aa  1283    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  56.49 
 
 		 578 aa  665    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  61.01 
 
 		 581 aa  741    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.14 
 
 		 580 aa  608  9.999999999999999e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  52.96 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  55.83 
 
 		 579 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 576 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.56 
 
 		 576 aa  529  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 616 aa  495  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  43.64 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  46.02 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  43.32 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  42.5 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  40.14 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  39.51 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 578 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  39.86 
 
 		 574 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  37.84 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  37.59 
 
 		 577 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  37.59 
 
 		 577 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  43.18 
 
 		 741 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  39.5 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.5 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.5 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.5 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  41.41 
 
 		 742 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.8 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  37.91 
 
 		 577 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.03 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.85 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.78 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.6 
 
 		 584 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  35.96 
 
 		 577 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  35.86 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  38.28 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.42 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  37.25 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.86 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 		 584 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.7 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  38.16 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  38.28 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  39.11 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  36.72 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  36.08 
 
 		 577 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  39.7 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  35.96 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 577 aa  359  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.41 
 
 		 584 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 576 aa  357  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  36.27 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  35.44 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  38.33 
 
 		 755 aa  353  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  36.98 
 
 		 741 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.69 
 
 		 741 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 582 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.86 
 
 		 654 aa  352  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.71 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  37.52 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  37.39 
 
 		 584 aa  352  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  37.45 
 
 		 575 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  35.92 
 
 		 575 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  34.78 
 
 		 577 aa  349  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.11 
 
 		 572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  38.2 
 
 		 575 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 		 594 aa  343  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  36.7 
 
 		 591 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  36.48 
 
 		 755 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  34.67 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  34.67 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  34.67 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  34.02 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.86 
 
 		 579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.39 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  36.08 
 
 		 577 aa  337  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.08 
 
 		 579 aa  335  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  34.6 
 
 		 581 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.67 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.78 
 
 		 765 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  34.78 
 
 		 577 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.78 
 
 		 765 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 584 aa  332  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.92 
 
 		 601 aa  330  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  35.61 
 
 		 577 aa  329  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  36.46 
 
 		 585 aa  329  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  34.66 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.22 
 
 		 587 aa  328  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 581 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  33.98 
 
 		 580 aa  324  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.92 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.13 
 
 		 623 aa  323  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.19 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.71 
 
 		 641 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>