More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3549 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3581  ABC transporter related  55.57 
 
 		 599 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.689947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  100 
 
 		 614 aa  1237    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  55.43 
 
 		 595 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  88.42 
 
 		 613 aa  1072    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  52.1 
 
 		 582 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.08 
 
 		 581 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.65 
 
 		 556 aa  340  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.16 
 
 		 606 aa  340  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.33 
 
 		 581 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.36 
 
 		 601 aa  326  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.01 
 
 		 588 aa  326  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.28 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  39.47 
 
 		 641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  38.9 
 
 		 581 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  33.04 
 
 		 582 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  36.8 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.77 
 
 		 614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 581 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.38 
 
 		 642 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.63 
 
 		 584 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.15 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.62 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 575 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.51 
 
 		 608 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  35.04 
 
 		 589 aa  303  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  38.59 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  33.27 
 
 		 594 aa  302  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.15 
 
 		 598 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 596 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  38.38 
 
 		 582 aa  300  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  34.15 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  37.78 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  33.09 
 
 		 589 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.1 
 
 		 597 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  36.33 
 
 		 602 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.25 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.69 
 
 		 589 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.25 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  34.68 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.31 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.67 
 
 		 602 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.05 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  34.36 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.32 
 
 		 582 aa  293  8e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.58 
 
 		 587 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  35.27 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.51 
 
 		 636 aa  292  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.98 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.39 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.55 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.33 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.27 
 
 		 571 aa  292  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.27 
 
 		 571 aa  292  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.11 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.84 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.27 
 
 		 571 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  34.52 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.27 
 
 		 571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  34.19 
 
 		 585 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.97 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  34.15 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 		 571 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 613 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  28.55 
 
 		 592 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  36.16 
 
 		 582 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 571 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.47 
 
 		 571 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.47 
 
 		 571 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.58 
 
 		 591 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 634 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.73 
 
 		 575 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.03 
 
 		 594 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.6 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.16 
 
 		 591 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  34.94 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.28 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  29.62 
 
 		 587 aa  287  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 		 571 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  33.45 
 
 		 622 aa  287  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.85 
 
 		 578 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.77 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.94 
 
 		 607 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.39 
 
 		 583 aa  287  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.85 
 
 		 578 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  34.41 
 
 		 607 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.35 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  35.25 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  35.4 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 773 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>