More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2278 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  100 
 
 		 591 aa  1186    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.21 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  38.78 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  41.29 
 
 		 606 aa  389  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  40.41 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  36.82 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  37.22 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  36.43 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  43.43 
 
 		 642 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  41.24 
 
 		 641 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  36.66 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.91 
 
 		 652 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.46 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  37.02 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  35.83 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.07 
 
 		 579 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  35.18 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  34.61 
 
 		 577 aa  343  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  37.29 
 
 		 592 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 584 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  35.88 
 
 		 581 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.76 
 
 		 577 aa  339  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.22 
 
 		 576 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.17 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  34.83 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.83 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.83 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  34.77 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.83 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.11 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  36.7 
 
 		 633 aa  336  5.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  35.97 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  35.78 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  35.2 
 
 		 583 aa  334  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  35.28 
 
 		 589 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  35.52 
 
 		 584 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  34.68 
 
 		 577 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.83 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.16 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  36.48 
 
 		 583 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  35.78 
 
 		 755 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.66 
 
 		 584 aa  330  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.14 
 
 		 577 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 		 580 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.55 
 
 		 589 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  35.5 
 
 		 577 aa  327  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  33.92 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.13 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.39 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  34.61 
 
 		 576 aa  325  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 581 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  33.86 
 
 		 577 aa  324  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  34.96 
 
 		 600 aa  323  5e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  34.39 
 
 		 578 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  33.59 
 
 		 741 aa  319  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  34.91 
 
 		 577 aa  319  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  35.01 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.04 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  33.33 
 
 		 580 aa  316  7e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 578 aa  316  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 576 aa  316  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  32.3 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  30.5 
 
 		 574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  35.49 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  34.47 
 
 		 742 aa  312  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  34.33 
 
 		 577 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  35.25 
 
 		 755 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  35.78 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  36.79 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  31.14 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  33.76 
 
 		 741 aa  310  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  34.21 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.67 
 
 		 672 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.21 
 
 		 654 aa  307  3e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34 
 
 		 598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  33.04 
 
 		 577 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.08 
 
 		 671 aa  306  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  35.24 
 
 		 748 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.59 
 
 		 598 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.15 
 
 		 592 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  30.98 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.65 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  35.54 
 
 		 765 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  36.07 
 
 		 589 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  33.39 
 
 		 577 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.81 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  32.99 
 
 		 577 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.36 
 
 		 765 aa  303  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  35.34 
 
 		 720 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  34.64 
 
 		 672 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.64 
 
 		 670 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  34.98 
 
 		 587 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 582 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>