More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 608 aa  1207    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  57.17 
 
 		 602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  53.65 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 650 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.82 
 
 		 612 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 596 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  47.04 
 
 		 631 aa  485  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  43.12 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  44.56 
 
 		 589 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 604 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  46.93 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  42.2 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  42.2 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  41.77 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  40.95 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  44.21 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  40.63 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  46.48 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  42.56 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  60.86 
 
 		 339 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.66 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.4 
 
 		 1522 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.07 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  30.91 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  36.38 
 
 		 1321 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.95 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.65 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  30.13 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.69 
 
 		 580 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.03 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.76 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.03 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.47 
 
 		 594 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.85 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.56 
 
 		 1257 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.06 
 
 		 589 aa  267  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  29.95 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 598 aa  267  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.96 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.1 
 
 		 593 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.48 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  31.19 
 
 		 641 aa  264  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3401  ABC transporter, transmembrane region  54.65 
 
 		 277 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0637636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.22 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.7 
 
 		 597 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  32.01 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.06 
 
 		 577 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 		 566 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.93 
 
 		 583 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.85 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  30.8 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  28.4 
 
 		 566 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  27.71 
 
 		 585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  34.71 
 
 		 1436 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 671 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.42 
 
 		 1284 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  30.85 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.35 
 
 		 608 aa  257  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 586 aa  257  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  28.98 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  29.34 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  30.54 
 
 		 642 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.7 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  31.1 
 
 		 591 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 		 584 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.08 
 
 		 637 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  29.36 
 
 		 598 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.14 
 
 		 584 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  33.67 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  25 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  28.45 
 
 		 574 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  34.23 
 
 		 589 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 623 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  28.47 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.38 
 
 		 640 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  30.38 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  27.85 
 
 		 578 aa  253  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.54 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  31.1 
 
 		 634 aa  252  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.54 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  28.08 
 
 		 580 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.24 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  27.59 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  32.01 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.4 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  28.42 
 
 		 572 aa  251  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  30.08 
 
 		 609 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  31.56 
 
 		 608 aa  250  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  29.64 
 
 		 604 aa  250  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  31 
 
 		 583 aa  250  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.13 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  32.81 
 
 		 1301 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.13 
 
 		 583 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.1 
 
 		 585 aa  249  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>