More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1226 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  65.75 
 
 		 615 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  58.29 
 
 		 650 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 595 aa  1163    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  58.29 
 
 		 650 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  58.93 
 
 		 641 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  57.65 
 
 		 633 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  56.88 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  52.64 
 
 		 604 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  56.6 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  56.81 
 
 		 605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  50.77 
 
 		 612 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  51.36 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  51.71 
 
 		 589 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  49.61 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 596 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  45.18 
 
 		 632 aa  402  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.56 
 
 		 608 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.67 
 
 		 612 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.97 
 
 		 588 aa  326  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.51 
 
 		 586 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.17 
 
 		 578 aa  310  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  38.02 
 
 		 1522 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.12 
 
 		 1284 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 572 aa  302  9e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.95 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.56 
 
 		 594 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.63 
 
 		 641 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.45 
 
 		 586 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 593 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.8 
 
 		 1321 aa  296  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.65 
 
 		 601 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.02 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.53 
 
 		 598 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  30.33 
 
 		 596 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  34.33 
 
 		 660 aa  293  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.78 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  34.48 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.87 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.66 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.59 
 
 		 587 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 1194 aa  290  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.66 
 
 		 593 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  33.54 
 
 		 583 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.4 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.02 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.43 
 
 		 582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.62 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.7 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  35.58 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.46 
 
 		 644 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  34.43 
 
 		 582 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.02 
 
 		 1257 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.39 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.88 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.39 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.18 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  31.98 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.4 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  33.52 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.27 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  31.09 
 
 		 594 aa  280  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.4 
 
 		 592 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.92 
 
 		 1436 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.89 
 
 		 589 aa  279  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  56.83 
 
 		 339 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  28.23 
 
 		 609 aa  278  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.11 
 
 		 578 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.62 
 
 		 608 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  33.33 
 
 		 582 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  32.11 
 
 		 589 aa  276  8e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.54 
 
 		 572 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  32.96 
 
 		 591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  29.62 
 
 		 613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.46 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.21 
 
 		 702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.17 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  30.05 
 
 		 593 aa  275  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.78 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.46 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.14 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.01 
 
 		 585 aa  273  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.98 
 
 		 571 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 		 571 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  29.82 
 
 		 622 aa  273  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.35 
 
 		 631 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.98 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.98 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.47 
 
 		 588 aa  273  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.67 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  33.21 
 
 		 642 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.42 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>