More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3785 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  59.45 
 
 		 604 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  92.42 
 
 		 607 aa  996    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  100 
 
 		 605 aa  1169    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  57.29 
 
 		 595 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  57.17 
 
 		 615 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  52.18 
 
 		 612 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  51.79 
 
 		 641 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  51.98 
 
 		 633 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  51.52 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  51.52 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  52 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  54.83 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  51.74 
 
 		 634 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  44.41 
 
 		 602 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  46.62 
 
 		 632 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.84 
 
 		 608 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 596 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.18 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 581 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.33 
 
 		 588 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.46 
 
 		 1522 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.05 
 
 		 641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  38.81 
 
 		 1436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.06 
 
 		 578 aa  307  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.06 
 
 		 578 aa  307  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.28 
 
 		 592 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.05 
 
 		 601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  32.57 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.11 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.17 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 598 aa  301  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.07 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.35 
 
 		 584 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  38.93 
 
 		 1321 aa  300  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  30.3 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  33.15 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  35.2 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.77 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.08 
 
 		 586 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.19 
 
 		 606 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  33.1 
 
 		 604 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.67 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.39 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.27 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  36.07 
 
 		 1301 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  34.15 
 
 		 642 aa  289  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  35.36 
 
 		 635 aa  289  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.18 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 620 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 1194 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.99 
 
 		 587 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.21 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.68 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.5 
 
 		 1284 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.65 
 
 		 601 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.57 
 
 		 610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.92 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  32.01 
 
 		 594 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.27 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.86 
 
 		 567 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.68 
 
 		 567 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.91 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  29.34 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.96 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.4 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 1218 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  33.4 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.27 
 
 		 1003 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.61 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  36.38 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.6 
 
 		 585 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  31.61 
 
 		 575 aa  279  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 593 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.71 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  36.3 
 
 		 613 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.32 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.28 
 
 		 597 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 569 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30.76 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.81 
 
 		 1001 aa  278  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.5 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 622 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.65 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  32.87 
 
 		 577 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.84 
 
 		 582 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.86 
 
 		 1257 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  35.02 
 
 		 610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.99 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.64 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.35 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.55 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  52.02 
 
 		 339 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.38 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.99 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.78 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>