More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3802 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  100 
 
 		 615 aa  1202    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  65.31 
 
 		 595 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  57.51 
 
 		 641 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  56.78 
 
 		 633 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  56.5 
 
 		 650 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  56.5 
 
 		 650 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 		 634 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 604 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  57.4 
 
 		 607 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  52.23 
 
 		 612 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  56.59 
 
 		 605 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  50.35 
 
 		 631 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  51.03 
 
 		 589 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  46.54 
 
 		 602 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  47.13 
 
 		 632 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  46.02 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.21 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 581 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.47 
 
 		 612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.32 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.7 
 
 		 581 aa  333  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.02 
 
 		 589 aa  327  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.56 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.2 
 
 		 1522 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 598 aa  316  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  33.39 
 
 		 578 aa  316  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.06 
 
 		 601 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.84 
 
 		 641 aa  313  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  34.99 
 
 		 642 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.22 
 
 		 587 aa  310  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.05 
 
 		 606 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.2 
 
 		 1321 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.84 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 		 578 aa  306  7e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.97 
 
 		 1284 aa  306  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.24 
 
 		 578 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.24 
 
 		 578 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 577 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.28 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.48 
 
 		 1257 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  31.34 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  30.24 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  34.79 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 1194 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  32.46 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  35.09 
 
 		 577 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.05 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  32.99 
 
 		 583 aa  299  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.21 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.41 
 
 		 577 aa  296  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.33 
 
 		 1436 aa  296  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.64 
 
 		 618 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.69 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.16 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  34.03 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.38 
 
 		 601 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  31.1 
 
 		 609 aa  294  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.48 
 
 		 588 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  34.87 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  34.87 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  34.87 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.52 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.09 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  32.7 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  32.24 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.16 
 
 		 631 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  32.75 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 		 598 aa  291  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.78 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  32.47 
 
 		 577 aa  291  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  30.55 
 
 		 593 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.14 
 
 		 573 aa  290  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  36.14 
 
 		 636 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.9 
 
 		 577 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  34.21 
 
 		 577 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  33.56 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.07 
 
 		 577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  33.54 
 
 		 589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.27 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.69 
 
 		 604 aa  287  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.29 
 
 		 602 aa  286  5.999999999999999e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.82 
 
 		 583 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 581 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.73 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.18 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  32.98 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.79 
 
 		 556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  31.42 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.95 
 
 		 622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.43 
 
 		 582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.62 
 
 		 627 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  34.74 
 
 		 577 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.8 
 
 		 606 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.92 
 
 		 617 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  34.15 
 
 		 641 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.41 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.28 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>