More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  62.22 
 
 		 577 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  63.81 
 
 		 577 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  63.84 
 
 		 581 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  56.62 
 
 		 577 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  63.37 
 
 		 577 aa  749    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  54.36 
 
 		 577 aa  656    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  60.87 
 
 		 577 aa  698    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  63.78 
 
 		 577 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  57.37 
 
 		 595 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  59.45 
 
 		 577 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  59.03 
 
 		 577 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.47 
 
 		 578 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  59.62 
 
 		 577 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  69.54 
 
 		 581 aa  770    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  62.31 
 
 		 582 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.94 
 
 		 587 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 579 aa  1164    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  63.49 
 
 		 578 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  57.37 
 
 		 595 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  64.99 
 
 		 577 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  65.8 
 
 		 577 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  57.37 
 
 		 595 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  58.58 
 
 		 577 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  56.37 
 
 		 586 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  67.58 
 
 		 583 aa  707    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  63.75 
 
 		 577 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  68.28 
 
 		 577 aa  739    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 582 aa  631  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  55.9 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.36 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 582 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  57.52 
 
 		 584 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.49 
 
 		 585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  53.21 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  56.59 
 
 		 584 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  48.78 
 
 		 575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  46.05 
 
 		 584 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  46.09 
 
 		 574 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  48.52 
 
 		 575 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  50.19 
 
 		 755 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  47.05 
 
 		 741 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  50.68 
 
 		 589 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.91 
 
 		 741 aa  527  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  46.27 
 
 		 741 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  48.77 
 
 		 748 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  50.37 
 
 		 755 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  46.45 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  44.48 
 
 		 577 aa  505  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.82 
 
 		 765 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  45.82 
 
 		 765 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  44.01 
 
 		 742 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  41.16 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.48 
 
 		 719 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  48.77 
 
 		 720 aa  485  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.55 
 
 		 654 aa  484  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  42.21 
 
 		 578 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  41.24 
 
 		 583 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  41.29 
 
 		 575 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  42 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  41.83 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  43.04 
 
 		 580 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.13 
 
 		 577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 		 577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  43.64 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  39.34 
 
 		 578 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 576 aa  465  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  42.74 
 
 		 585 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.49 
 
 		 583 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  37.76 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.76 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.76 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.76 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 		 584 aa  429  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.76 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  39.03 
 
 		 623 aa  425  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.07 
 
 		 604 aa  429  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.59 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.06 
 
 		 584 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.86 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 581 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.59 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  40.92 
 
 		 583 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.46 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.49 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.29 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  36.51 
 
 		 578 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.5 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36.67 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  36.14 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.11 
 
 		 580 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  37.8 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.18 
 
 		 601 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38 
 
 		 606 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  39.82 
 
 		 641 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.68 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>