More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3940 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.37 
 
 
579 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  58.6 
 
 
577 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  73.02 
 
 
582 aa  867    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  58.6 
 
 
577 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  55.61 
 
 
577 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  100 
 
 
595 aa  1188    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  60.7 
 
 
577 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  56.52 
 
 
582 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  57.62 
 
 
578 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  100 
 
 
595 aa  1188    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  78.28 
 
 
594 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  100 
 
 
595 aa  1188    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  57.24 
 
 
577 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  77.19 
 
 
586 aa  919    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  60.35 
 
 
577 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  56.49 
 
 
577 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  57.24 
 
 
581 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  54.74 
 
 
577 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  52.11 
 
 
577 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  52.78 
 
 
577 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  51.75 
 
 
577 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  54.91 
 
 
577 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.37 
 
 
578 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  56.45 
 
 
581 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  54.74 
 
 
577 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  49.65 
 
 
582 aa  572  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.52 
 
 
587 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
584 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  48.15 
 
 
577 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.6 
 
 
585 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  51.65 
 
 
577 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  55.21 
 
 
583 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  53.44 
 
 
584 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.47 
 
 
578 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  43.62 
 
 
584 aa  522  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  49.82 
 
 
578 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  46.9 
 
 
575 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  45.55 
 
 
575 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  42.83 
 
 
574 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  46.22 
 
 
589 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  44.57 
 
 
755 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  42.86 
 
 
741 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  39.85 
 
 
742 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  42.08 
 
 
741 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  38.76 
 
 
577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.03 
 
 
741 aa  452  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  38.91 
 
 
575 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  39.08 
 
 
576 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.48 
 
 
765 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  41.37 
 
 
765 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  40.99 
 
 
755 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  38.87 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  40.77 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.84 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.68 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  38.87 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  40.15 
 
 
748 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  37.46 
 
 
578 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 
593 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  36.61 
 
 
573 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.16 
 
 
719 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.74 
 
 
654 aa  428  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  41.43 
 
 
586 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  39.82 
 
 
580 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.99 
 
 
583 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  43.88 
 
 
720 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  35.31 
 
 
583 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  36.27 
 
 
578 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.32 
 
 
579 aa  415  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  34.16 
 
 
578 aa  415  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.84 
 
 
578 aa  415  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.22 
 
 
584 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  36.04 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.04 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.04 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.04 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.69 
 
 
584 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.51 
 
 
584 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.51 
 
 
584 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  35.75 
 
 
584 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 
584 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  35.73 
 
 
574 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  39.35 
 
 
585 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  38.3 
 
 
583 aa  378  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.55 
 
 
579 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  33.74 
 
 
578 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.61 
 
 
623 aa  379  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  36.35 
 
 
581 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.4 
 
 
604 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  36.12 
 
 
575 aa  365  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  35.92 
 
 
600 aa  363  6e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.16 
 
 
652 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  34.19 
 
 
582 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  35.7 
 
 
578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 
580 aa  354  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  34.49 
 
 
594 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  34.67 
 
 
633 aa  346  8e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  31.45 
 
 
576 aa  346  8.999999999999999e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>