More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4712 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  100 
 
 		 631 aa  1233    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  60.28 
 
 		 589 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  52.53 
 
 		 612 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  49.42 
 
 		 604 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  48.73 
 
 		 633 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  51.36 
 
 		 595 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  49.22 
 
 		 650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  49.22 
 
 		 650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  48.81 
 
 		 641 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  52.5 
 
 		 607 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  50 
 
 		 602 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  50 
 
 		 596 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 		 634 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  49.34 
 
 		 632 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  49.75 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  52 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.04 
 
 		 608 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 650 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.5 
 
 		 612 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.86 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 598 aa  306  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.02 
 
 		 1522 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.17 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  38.4 
 
 		 1321 aa  300  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.34 
 
 		 580 aa  300  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.63 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.63 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.47 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.12 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.58 
 
 		 588 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  32.03 
 
 		 586 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.23 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.51 
 
 		 556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.28 
 
 		 567 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.28 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  56.23 
 
 		 339 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  32.72 
 
 		 641 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.43 
 
 		 601 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.78 
 
 		 587 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.95 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  32.92 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.47 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.86 
 
 		 567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.52 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.57 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.14 
 
 		 1284 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  34.51 
 
 		 602 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.19 
 
 		 578 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.37 
 
 		 617 aa  283  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  31.88 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  27.53 
 
 		 574 aa  282  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  35.42 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.28 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 620 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.28 
 
 		 597 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.37 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.69 
 
 		 598 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.97 
 
 		 637 aa  280  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.48 
 
 		 584 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.33 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.33 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 726 aa  280  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.62 
 
 		 593 aa  280  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 571 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.58 
 
 		 594 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.96 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  33.22 
 
 		 566 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.72 
 
 		 620 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.5 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.84 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.19 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.34 
 
 		 768 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.82 
 
 		 586 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.75 
 
 		 572 aa  278  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.71 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.71 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.74 
 
 		 584 aa  278  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  28.16 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.45 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.45 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.16 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.33 
 
 		 586 aa  277  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.08 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  37.28 
 
 		 602 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.5 
 
 		 586 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  32.2 
 
 		 594 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.1 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.91 
 
 		 586 aa  276  8e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.14 
 
 		 602 aa  276  8e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.84 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.62 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>