More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1440 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  100 
 
 
596 aa  1141    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  57.97 
 
 
632 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  54.19 
 
 
602 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  59.86 
 
 
650 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  50 
 
 
631 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.76 
 
 
608 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  49.39 
 
 
589 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.57 
 
 
612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  45.6 
 
 
612 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  44.82 
 
 
641 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  45.55 
 
 
633 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  44.56 
 
 
650 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  44.56 
 
 
650 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
604 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  47.61 
 
 
607 aa  412  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  44.94 
 
 
634 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  46.13 
 
 
595 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  46.26 
 
 
615 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  47.07 
 
 
605 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
581 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.99 
 
 
1522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.21 
 
 
1321 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  55.82 
 
 
339 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.38 
 
 
1257 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
600 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.93 
 
 
1301 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.98 
 
 
576 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
598 aa  278  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.29 
 
 
572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.04 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.51 
 
 
584 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.29 
 
 
572 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  33.01 
 
 
641 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  33.8 
 
 
591 aa  273  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  39.23 
 
 
1436 aa  273  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
596 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.38 
 
 
588 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
1218 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.17 
 
 
614 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.74 
 
 
572 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  31.37 
 
 
784 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.84 
 
 
580 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.1 
 
 
573 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.22 
 
 
577 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.19 
 
 
578 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.19 
 
 
578 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  30.07 
 
 
782 aa  269  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31 
 
 
588 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.91 
 
 
556 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.05 
 
 
764 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  33.33 
 
 
610 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.94 
 
 
572 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.14 
 
 
1284 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.12 
 
 
572 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.76 
 
 
608 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.16 
 
 
582 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.1 
 
 
589 aa  267  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.79 
 
 
636 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.49 
 
 
584 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
620 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.86 
 
 
597 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.82 
 
 
582 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.05 
 
 
585 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.33 
 
 
575 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
1194 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.92 
 
 
587 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  30.86 
 
 
773 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  30.24 
 
 
764 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  30.92 
 
 
592 aa  263  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.26 
 
 
768 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.45 
 
 
627 aa  262  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  31.77 
 
 
784 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.2 
 
 
578 aa  261  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  30.71 
 
 
784 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.26 
 
 
602 aa  261  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.34 
 
 
583 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.57 
 
 
585 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  27.94 
 
 
594 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  30.09 
 
 
782 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  30.71 
 
 
777 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.95 
 
 
567 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.94 
 
 
597 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.94 
 
 
597 aa  259  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  33.56 
 
 
581 aa  259  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  28.16 
 
 
597 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.82 
 
 
594 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  31.63 
 
 
568 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.95 
 
 
567 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  28.9 
 
 
768 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.15 
 
 
571 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.79 
 
 
622 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  31.59 
 
 
750 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  28.9 
 
 
814 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  31.39 
 
 
770 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  30.03 
 
 
615 aa  257  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.32 
 
 
571 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.32 
 
 
571 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.32 
 
 
571 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.03 
 
 
591 aa  257  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  28.92 
 
 
587 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>