More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0519 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  100 
 
 		 589 aa  1143    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  60.62 
 
 		 631 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  50.42 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  48.79 
 
 		 641 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  48.72 
 
 		 633 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  54.66 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 604 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  50.26 
 
 		 602 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  48.04 
 
 		 650 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  48.04 
 
 		 650 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  50.58 
 
 		 632 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  54.83 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  51.64 
 
 		 595 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 634 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  51.22 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 650 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.24 
 
 		 608 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.41 
 
 		 612 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.65 
 
 		 581 aa  349  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  39.35 
 
 		 1522 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.9 
 
 		 581 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  35.57 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  41.88 
 
 		 1284 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.57 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.13 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  33.33 
 
 		 575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.58 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.36 
 
 		 606 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  35.66 
 
 		 586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.3 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.3 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.29 
 
 		 641 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  38.43 
 
 		 1321 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.91 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  35.89 
 
 		 587 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  34.35 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  31.95 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.91 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.49 
 
 		 583 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.58 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.27 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.35 
 
 		 584 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  34.36 
 
 		 583 aa  296  8e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  34.64 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  37.63 
 
 		 652 aa  293  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.57 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.45 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 1194 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.01 
 
 		 593 aa  289  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.98 
 
 		 1257 aa  289  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  34.63 
 
 		 642 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.64 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  30.19 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.02 
 
 		 582 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.95 
 
 		 588 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.75 
 
 		 611 aa  286  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.93 
 
 		 594 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.35 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  34.75 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.06 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  31.54 
 
 		 588 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.47 
 
 		 594 aa  283  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.51 
 
 		 586 aa  283  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.29 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  32.94 
 
 		 589 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30 
 
 		 594 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.73 
 
 		 1301 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.98 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3402  ABC transporter related  55.06 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.620244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.04 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  35.58 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.8 
 
 		 567 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  30.32 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.13 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.22 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 607 aa  280  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 		 582 aa  280  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.63 
 
 		 585 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 575 aa  279  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.04 
 
 		 602 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  39.37 
 
 		 1230 aa  279  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.23 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 585 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.79 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.05 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  31.95 
 
 		 585 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.7 
 
 		 597 aa  278  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.32 
 
 		 631 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 620 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.58 
 
 		 601 aa  278  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  37.72 
 
 		 1264 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 589 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.72 
 
 		 582 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>