More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1947 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.69 
 
 
580 aa  693    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  53.44 
 
 
583 aa  651    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  60.66 
 
 
582 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  55.03 
 
 
633 aa  652    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  55.03 
 
 
589 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  56.82 
 
 
578 aa  696    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  100 
 
 
652 aa  1341    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  53.73 
 
 
581 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 
616 aa  631  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  53.73 
 
 
579 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
576 aa  585  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.69 
 
 
576 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  45.23 
 
 
578 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  43.01 
 
 
587 aa  475  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  42.2 
 
 
600 aa  474  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  41.97 
 
 
575 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.97 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  38.64 
 
 
578 aa  439  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  38.97 
 
 
577 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  38.06 
 
 
577 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  38.24 
 
 
577 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  39.22 
 
 
577 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  37.04 
 
 
575 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  43.76 
 
 
741 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.02 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  36.85 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.85 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.85 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.85 
 
 
584 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.02 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  35.37 
 
 
574 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.68 
 
 
584 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.86 
 
 
579 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  41.39 
 
 
742 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.85 
 
 
584 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.02 
 
 
584 aa  399  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.6 
 
 
654 aa  399  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  37.69 
 
 
574 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  35.25 
 
 
584 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.5 
 
 
579 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  37.15 
 
 
577 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  35.57 
 
 
583 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  36.03 
 
 
584 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.95 
 
 
577 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
577 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  36.96 
 
 
582 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  37.24 
 
 
577 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  37.63 
 
 
577 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  37.28 
 
 
577 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  37.72 
 
 
577 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.12 
 
 
577 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  37.26 
 
 
578 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
582 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  37.21 
 
 
577 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  39.02 
 
 
755 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  36.88 
 
 
577 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  34.23 
 
 
594 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  40.5 
 
 
748 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  37.86 
 
 
575 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.4 
 
 
578 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.59 
 
 
623 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  36.66 
 
 
581 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  35.26 
 
 
586 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.59 
 
 
583 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.36 
 
 
578 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
577 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  37.27 
 
 
741 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  36.06 
 
 
577 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  38.66 
 
 
755 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  37.02 
 
 
586 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.85 
 
 
741 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 
594 aa  363  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
576 aa  362  8e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  34.1 
 
 
573 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.9 
 
 
577 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  36.71 
 
 
577 aa  359  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
581 aa  359  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  35.33 
 
 
580 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  36.44 
 
 
581 aa  359  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.39 
 
 
579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.7 
 
 
582 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.1 
 
 
606 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.62 
 
 
601 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  36.6 
 
 
577 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
578 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  36.46 
 
 
577 aa  348  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  37.3 
 
 
720 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  33.16 
 
 
595 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  33.16 
 
 
595 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  33.16 
 
 
595 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.81 
 
 
765 aa  346  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  34.91 
 
 
591 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  35.57 
 
 
585 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.58 
 
 
585 aa  345  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.05 
 
 
572 aa  344  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.43 
 
 
765 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
593 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  36.46 
 
 
575 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>