More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1737 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 576 aa  1176    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  53.42 
 
 		 578 aa  628  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  50.69 
 
 		 652 aa  607  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  53.22 
 
 		 582 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  50.35 
 
 		 583 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.26 
 
 		 580 aa  573  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  50.44 
 
 		 589 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 581 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  50.18 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  49.56 
 
 		 633 aa  548  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  50.62 
 
 		 579 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  46.44 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 616 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  42.12 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  40.46 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 581 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  39.38 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  40.32 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  39.93 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  37.09 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  37.09 
 
 		 577 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.97 
 
 		 579 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 578 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  35.11 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.22 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  35.99 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  35.04 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.08 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  37.08 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.08 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.08 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  35.83 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  41.4 
 
 		 742 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.91 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.32 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.77 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 578 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.49 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  36.86 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.43 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  36.33 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  35.17 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  34.86 
 
 		 575 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.91 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 582 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.7 
 
 		 584 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  39.07 
 
 		 741 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  35.9 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.33 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 576 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.22 
 
 		 654 aa  363  3e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.71 
 
 		 583 aa  363  6e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  37.43 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  34.74 
 
 		 573 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  34.14 
 
 		 577 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  35.74 
 
 		 577 aa  356  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  35.59 
 
 		 577 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  35.02 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  36.98 
 
 		 741 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  32.22 
 
 		 578 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  38.32 
 
 		 748 aa  346  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  35.1 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  35.22 
 
 		 591 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  33.28 
 
 		 577 aa  342  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  34.27 
 
 		 581 aa  340  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  31.94 
 
 		 586 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  32.76 
 
 		 580 aa  339  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 583 aa  339  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  34.27 
 
 		 581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  32.81 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  32.98 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  34.49 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.62 
 
 		 577 aa  334  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.22 
 
 		 765 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.22 
 
 		 765 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.57 
 
 		 582 aa  332  8e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.09 
 
 		 606 aa  332  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  34.35 
 
 		 755 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  32.81 
 
 		 577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.12 
 
 		 585 aa  329  9e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  34.31 
 
 		 578 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  36.43 
 
 		 755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 578 aa  326  6e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  31.61 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  31.61 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  31.61 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.56 
 
 		 741 aa  325  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.93 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 		 579 aa  324  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  36.2 
 
 		 575 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.05 
 
 		 601 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  33.45 
 
 		 577 aa  323  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  34.31 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  33.39 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>