More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0396 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  61.5 
 
 		 575 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  100 
 
 		 574 aa  1158    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  47.08 
 
 		 583 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.17 
 
 		 573 aa  477  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  42.58 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  42.31 
 
 		 575 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0799  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.11 
 
 		 579 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  42.26 
 
 		 578 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  43.38 
 
 		 575 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  40.91 
 
 		 577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  42.68 
 
 		 581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  41.43 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  40.9 
 
 		 582 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  41.3 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  42.03 
 
 		 577 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.56 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  40.56 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  40.56 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  41.27 
 
 		 584 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.56 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  39.96 
 
 		 577 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.18 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  41.57 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.92 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  41.84 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  40.35 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.09 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.62 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  39.37 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  40.18 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.35 
 
 		 584 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  39.6 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  42.18 
 
 		 741 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  42.44 
 
 		 748 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.37 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  39.49 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.25 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  40.41 
 
 		 742 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  38.21 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  37.59 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  38.27 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  39.18 
 
 		 755 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 		 577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.56 
 
 		 765 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  42.94 
 
 		 765 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  39.9 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.63 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 581 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  38.01 
 
 		 586 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.21 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  37.87 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  38.46 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  38.99 
 
 		 589 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.86 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  39.12 
 
 		 741 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  40.45 
 
 		 755 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 582 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  38.61 
 
 		 577 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  38.74 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  39.4 
 
 		 579 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  36.98 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  37.39 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  37.39 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.6 
 
 		 741 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.91 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  38.93 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  38.96 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.13 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.28 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  37.52 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  36.09 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.22 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.43 
 
 		 578 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.57 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  37.98 
 
 		 577 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  37.63 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.3 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  40.75 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  35.73 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  35.73 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  35.73 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.26 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  39.89 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  36.44 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  37.36 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 582 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  36.22 
 
 		 578 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  38.17 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.3 
 
 		 576 aa  361  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  36.67 
 
 		 720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.7 
 
 		 719 aa  356  5.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>