More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2430 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  61.5 
 
 		 574 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  100 
 
 		 575 aa  1166    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  48.28 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.41 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  40.24 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0799  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.42 
 
 		 579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  41.61 
 
 		 577 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  40.46 
 
 		 578 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  41 
 
 		 578 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  39.86 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  39.65 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  38.46 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  39.62 
 
 		 577 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  43.95 
 
 		 748 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  39.44 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  40.75 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  39.58 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  40.18 
 
 		 581 aa  425  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  38.37 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  39.67 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  37.52 
 
 		 586 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.68 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  39.68 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.33 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.68 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.51 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  38.49 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  39.05 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.86 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  40.21 
 
 		 584 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  38.16 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.74 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  40.46 
 
 		 755 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.86 
 
 		 584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  37.17 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  37.5 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  38.33 
 
 		 575 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  38.18 
 
 		 577 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  37.65 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  37.74 
 
 		 582 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  40.22 
 
 		 755 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  40.34 
 
 		 741 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  37.04 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  36.6 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.65 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  41.84 
 
 		 765 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 581 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.28 
 
 		 741 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  36.85 
 
 		 584 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  36.14 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  36.12 
 
 		 595 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  36.06 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  36.12 
 
 		 595 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  36.12 
 
 		 595 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  38.17 
 
 		 741 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  38.35 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.17 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  36.35 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.68 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.02 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  38.43 
 
 		 577 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.97 
 
 		 652 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  37.06 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.29 
 
 		 585 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  37.22 
 
 		 577 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  38.2 
 
 		 633 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  37.11 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.88 
 
 		 578 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  38.74 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 576 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  38.55 
 
 		 742 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.04 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.41 
 
 		 654 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.32 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  36.81 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  36.91 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 		 593 aa  372  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 581 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  35.85 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  37.3 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.34 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  37.06 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 576 aa  363  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  36.7 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.62 
 
 		 623 aa  351  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 616 aa  349  7e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  36.04 
 
 		 584 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  39.04 
 
 		 585 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 583 aa  343  7e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>