More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0360 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 580 aa  1193    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  54.33 
 
 		 589 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  57.69 
 
 		 652 aa  708    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  61.55 
 
 		 582 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  58.79 
 
 		 578 aa  718    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 581 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  52.6 
 
 		 583 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  53.14 
 
 		 633 aa  611  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  55.17 
 
 		 579 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 616 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.26 
 
 		 576 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 576 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  44.29 
 
 		 578 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  42.31 
 
 		 600 aa  486  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  39.83 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  39.97 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  40 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  38.26 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  38.09 
 
 		 587 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 581 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  38.61 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  35.41 
 
 		 574 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 574 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.28 
 
 		 654 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.67 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.22 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  36.52 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.52 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.52 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.52 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  36.35 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  35.91 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.57 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.46 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  36.41 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.11 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  39.74 
 
 		 741 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.67 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  36.52 
 
 		 584 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  34.37 
 
 		 575 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  39.01 
 
 		 742 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  35.25 
 
 		 573 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  36.14 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  34.42 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  33.39 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  34.49 
 
 		 577 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.31 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.69 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  34.25 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.32 
 
 		 583 aa  365  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.1 
 
 		 582 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  33.51 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.42 
 
 		 577 aa  363  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 		 594 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  32.99 
 
 		 578 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  35.62 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 581 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  34.55 
 
 		 581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  33.96 
 
 		 577 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  37.69 
 
 		 755 aa  356  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  33.85 
 
 		 577 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.03 
 
 		 577 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  36.06 
 
 		 741 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  33.99 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.76 
 
 		 579 aa  352  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.27 
 
 		 578 aa  352  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  33.57 
 
 		 581 aa  351  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  34.43 
 
 		 577 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  32.58 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  32.58 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  32.58 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  36.51 
 
 		 755 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  34.73 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.67 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  37.88 
 
 		 748 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.49 
 
 		 741 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  36.1 
 
 		 585 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 578 aa  343  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  37.04 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  32.53 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.96 
 
 		 578 aa  339  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  34.83 
 
 		 577 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  31.42 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 		 593 aa  336  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.4 
 
 		 765 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.62 
 
 		 601 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 579 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  31.97 
 
 		 580 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.22 
 
 		 765 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  33.05 
 
 		 578 aa  331  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.4 
 
 		 606 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>