More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1691 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  100 
 
 		 580 aa  1184    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.73 
 
 		 654 aa  665    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.69 
 
 		 583 aa  616  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 		 593 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  47.2 
 
 		 573 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  43.87 
 
 		 574 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  44.74 
 
 		 582 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  44.82 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  44.17 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  44.39 
 
 		 575 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  44.96 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  43.72 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  44.29 
 
 		 575 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.07 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  41.93 
 
 		 584 aa  467  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  42.26 
 
 		 581 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 581 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  41.73 
 
 		 577 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  42.58 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  41.07 
 
 		 577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  44.42 
 
 		 755 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  40.53 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.39 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.15 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.95 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  41.56 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  44.02 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  41.45 
 
 		 577 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  42.42 
 
 		 741 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  41.94 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  43.1 
 
 		 755 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  44.34 
 
 		 748 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  39.93 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  42.6 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.7 
 
 		 765 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  44.89 
 
 		 765 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  42.55 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.45 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.96 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  43.13 
 
 		 742 aa  432  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  40.92 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  40.97 
 
 		 577 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  41.11 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  39.69 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  41.82 
 
 		 577 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.52 
 
 		 577 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 581 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  42.83 
 
 		 741 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  39.15 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  41.73 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.83 
 
 		 741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  39.29 
 
 		 578 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  39.82 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  39.82 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  39.82 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  39.28 
 
 		 582 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  40.89 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  41.28 
 
 		 720 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  40.48 
 
 		 585 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.81 
 
 		 604 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  39.03 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  36.62 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  39.69 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  39.23 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  39.89 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.28 
 
 		 623 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 576 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.29 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.93 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.62 
 
 		 578 aa  372  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  34.11 
 
 		 578 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.04 
 
 		 579 aa  362  8e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  36.96 
 
 		 600 aa  362  9e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.45 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  34.33 
 
 		 584 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.33 
 
 		 584 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.33 
 
 		 584 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.33 
 
 		 584 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.33 
 
 		 652 aa  359  8e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 581 aa  359  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.1 
 
 		 584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  35.86 
 
 		 581 aa  357  3.9999999999999996e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.76 
 
 		 719 aa  356  5.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  35.09 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  35.99 
 
 		 589 aa  355  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 		 584 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  35.81 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.72 
 
 		 573 aa  351  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  34.63 
 
 		 584 aa  349  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 584 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0799  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.88 
 
 		 579 aa  347  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  35.31 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>