More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2245 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.55 
 
 
580 aa  743    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  58.86 
 
 
589 aa  709    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  55.61 
 
 
576 aa  656    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  59.45 
 
 
583 aa  721    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  61.21 
 
 
579 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  55.67 
 
 
633 aa  638    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  60.66 
 
 
652 aa  744    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  100 
 
 
582 aa  1194    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  65.75 
 
 
578 aa  785    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  59.55 
 
 
581 aa  710    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.22 
 
 
576 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 
616 aa  550  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  47.9 
 
 
578 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  43.18 
 
 
578 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  44.11 
 
 
600 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  43.13 
 
 
577 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  44.81 
 
 
581 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  40.91 
 
 
587 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  40.38 
 
 
575 aa  452  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  40.72 
 
 
577 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  40.72 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
578 aa  445  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.82 
 
 
579 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  39.45 
 
 
583 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  41.01 
 
 
577 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  37.11 
 
 
574 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  39.49 
 
 
574 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.66 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.66 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.84 
 
 
584 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.15 
 
 
584 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  38.63 
 
 
584 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.63 
 
 
584 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.67 
 
 
584 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.63 
 
 
584 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.63 
 
 
584 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  36.54 
 
 
584 aa  412  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.97 
 
 
584 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  42.64 
 
 
742 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
584 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  35.8 
 
 
575 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 
577 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 
577 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.23 
 
 
583 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  37.2 
 
 
594 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
578 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  38.62 
 
 
577 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
582 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.14 
 
 
579 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  38.21 
 
 
575 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  36.85 
 
 
577 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.49 
 
 
654 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  40.19 
 
 
741 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.96 
 
 
582 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  37.48 
 
 
577 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  38.62 
 
 
741 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  37.98 
 
 
577 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.56 
 
 
578 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.19 
 
 
572 aa  379  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  36.91 
 
 
578 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  36.16 
 
 
586 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  36.93 
 
 
577 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
576 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.46 
 
 
623 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  35.05 
 
 
573 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  36.53 
 
 
577 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  39.81 
 
 
755 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  39.11 
 
 
748 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  38.32 
 
 
577 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
594 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  36.11 
 
 
581 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.29 
 
 
577 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  36.24 
 
 
577 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  35.7 
 
 
577 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
577 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  40.49 
 
 
765 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  35.58 
 
 
577 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  36.83 
 
 
755 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  35.89 
 
 
580 aa  362  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.45 
 
 
765 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 
741 aa  360  5e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.09 
 
 
601 aa  360  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.06 
 
 
606 aa  359  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.54 
 
 
578 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  37.74 
 
 
575 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.22 
 
 
587 aa  355  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.36 
 
 
579 aa  353  5.9999999999999994e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  36.16 
 
 
585 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.87 
 
 
577 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  34.09 
 
 
581 aa  350  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  36.13 
 
 
577 aa  349  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.32 
 
 
579 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  37.79 
 
 
586 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  34.78 
 
 
578 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
582 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  34.19 
 
 
595 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  34.19 
 
 
595 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  34.19 
 
 
595 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  35.06 
 
 
577 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>