More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2251 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  68.86 
 
 
582 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  55.67 
 
 
577 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  77.19 
 
 
595 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.37 
 
 
579 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  57.59 
 
 
577 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  53.98 
 
 
582 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  57.49 
 
 
578 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  77.19 
 
 
595 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  56.72 
 
 
577 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  86.18 
 
 
594 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  77.19 
 
 
595 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  59.55 
 
 
577 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  100 
 
 
586 aa  1176    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  58.71 
 
 
577 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  55.32 
 
 
577 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  52.18 
 
 
577 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  55.13 
 
 
577 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  53.23 
 
 
577 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  53.23 
 
 
577 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  55.13 
 
 
581 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53 
 
 
578 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.8 
 
 
587 aa  585  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  50.52 
 
 
577 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
582 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  53.23 
 
 
577 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  49.12 
 
 
577 aa  574  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  53.23 
 
 
577 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  55.81 
 
 
581 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  53.83 
 
 
584 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  51.65 
 
 
577 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  54.83 
 
 
583 aa  545  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.67 
 
 
585 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.48 
 
 
578 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  49.65 
 
 
578 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  46.9 
 
 
575 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  44.6 
 
 
584 aa  525  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  52.81 
 
 
584 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  42.25 
 
 
574 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  45.42 
 
 
575 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  47.35 
 
 
589 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  43.65 
 
 
741 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  43.75 
 
 
755 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  44.27 
 
 
741 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  40.31 
 
 
575 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  41.3 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  40.14 
 
 
577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  41.48 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.88 
 
 
741 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  42.53 
 
 
742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  42.15 
 
 
748 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  41.3 
 
 
755 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  45.82 
 
 
720 aa  442  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  37.89 
 
 
583 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  37.8 
 
 
573 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.63 
 
 
719 aa  438  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.61 
 
 
765 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  42.61 
 
 
765 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
576 aa  435  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  40.95 
 
 
577 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 
593 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  38.14 
 
 
578 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  38.89 
 
 
578 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  42.77 
 
 
586 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.46 
 
 
577 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.13 
 
 
577 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
578 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  41.11 
 
 
580 aa  425  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.39 
 
 
654 aa  421  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
581 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.7 
 
 
579 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.37 
 
 
583 aa  411  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  37.06 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.06 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.06 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.43 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.15 
 
 
578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.06 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.08 
 
 
584 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.26 
 
 
584 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
574 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.91 
 
 
584 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  42.61 
 
 
585 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  37.26 
 
 
584 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.91 
 
 
584 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.13 
 
 
579 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  37.34 
 
 
578 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.49 
 
 
623 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 
584 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  38.07 
 
 
583 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  36.16 
 
 
582 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.23 
 
 
604 aa  375  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  37.96 
 
 
600 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  36.87 
 
 
581 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.26 
 
 
652 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  36.99 
 
 
575 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  35.61 
 
 
594 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  33.75 
 
 
576 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
578 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 
580 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.98 
 
 
601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>