More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  45.26 
 
 		 755 aa  648    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  55.28 
 
 		 720 aa  759    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 719 aa  1456    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  44.76 
 
 		 741 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  43.58 
 
 		 748 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.55 
 
 		 741 aa  610  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.97 
 
 		 765 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  43.25 
 
 		 765 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  42.82 
 
 		 741 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  42.38 
 
 		 742 aa  592  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  41.54 
 
 		 755 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  52.46 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  44.65 
 
 		 584 aa  505  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.87 
 
 		 579 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  46.32 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  46.21 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  47.48 
 
 		 586 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  47.92 
 
 		 575 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  47.62 
 
 		 577 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  44.55 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  46.78 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  46.97 
 
 		 575 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  45.78 
 
 		 582 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  45.34 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  45.64 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  44.32 
 
 		 577 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  42.59 
 
 		 623 aa  465  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  47.62 
 
 		 581 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  47.24 
 
 		 577 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  43.51 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  43.8 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  45.63 
 
 		 586 aa  459  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  44.92 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  45.75 
 
 		 577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  45.44 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 594 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.02 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 582 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  44.36 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  44.7 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  44.01 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  42.75 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.64 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  42.75 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.45 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  42.75 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.11 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.11 
 
 		 577 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  44.05 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  41.87 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.41 
 
 		 604 aa  420  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  45.19 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  40.34 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.72 
 
 		 654 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  41.19 
 
 		 576 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  41.3 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.52 
 
 		 579 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.55 
 
 		 585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  40.37 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  39.05 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  39.62 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  41.2 
 
 		 584 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 593 aa  392  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.87 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.89 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  39.69 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.71 
 
 		 584 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  38.9 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.59 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  43.03 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  37.62 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.34 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  37.34 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.34 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.9 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.34 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.9 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.57 
 
 		 584 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.96 
 
 		 584 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.09 
 
 		 584 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.19 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 574 aa  364  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  36.79 
 
 		 578 aa  363  6e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 581 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 584 aa  353  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.26 
 
 		 652 aa  352  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  36.38 
 
 		 573 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  35.9 
 
 		 582 aa  343  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36.57 
 
 		 594 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  38.09 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  36.7 
 
 		 581 aa  331  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.14 
 
 		 580 aa  330  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.66 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.79 
 
 		 606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.04 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>