More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0149 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  54.64 
 
 
574 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  100 
 
 
584 aa  1177    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  52.92 
 
 
575 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  50.09 
 
 
577 aa  585  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  50.34 
 
 
575 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  51.75 
 
 
742 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.05 
 
 
579 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  49.72 
 
 
741 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  45.53 
 
 
582 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  47.42 
 
 
577 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  44.16 
 
 
577 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  46.14 
 
 
577 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  43.7 
 
 
577 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  44.85 
 
 
577 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.56 
 
 
741 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  50.64 
 
 
748 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  44.67 
 
 
577 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  49.44 
 
 
741 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  45.19 
 
 
581 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  48.42 
 
 
755 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  43.37 
 
 
577 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  45.77 
 
 
577 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  46.74 
 
 
577 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  44.77 
 
 
577 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  43.3 
 
 
578 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  44.6 
 
 
586 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  45.25 
 
 
577 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.37 
 
 
587 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  43.45 
 
 
582 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50 
 
 
765 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  50.37 
 
 
765 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  49.44 
 
 
755 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.55 
 
 
578 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  43.37 
 
 
581 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  44.35 
 
 
575 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 
594 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  43.13 
 
 
577 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.8 
 
 
577 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.97 
 
 
577 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
583 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
577 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  43.62 
 
 
595 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  43.62 
 
 
595 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  43.62 
 
 
595 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  43.55 
 
 
577 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  41.37 
 
 
577 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.48 
 
 
654 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.65 
 
 
719 aa  488  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  42.76 
 
 
573 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.75 
 
 
578 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
576 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  44.46 
 
 
585 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  44.86 
 
 
720 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 
582 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  43.4 
 
 
577 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  43.79 
 
 
584 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  40.24 
 
 
577 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.9 
 
 
577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  43.56 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.3 
 
 
585 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  41.45 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  41.93 
 
 
580 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  44.8 
 
 
583 aa  462  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  40.86 
 
 
578 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  40.1 
 
 
583 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  41.44 
 
 
623 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 
593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  40 
 
 
581 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  40.7 
 
 
584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.22 
 
 
583 aa  445  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.4 
 
 
578 aa  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  39.48 
 
 
578 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.8 
 
 
579 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
578 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.95 
 
 
579 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.1 
 
 
604 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  37.44 
 
 
589 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
574 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  36.54 
 
 
582 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.37 
 
 
584 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.25 
 
 
652 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.98 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  37.05 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.05 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.25 
 
 
584 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.71 
 
 
584 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.05 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.05 
 
 
584 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 
584 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  37.59 
 
 
578 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  35.28 
 
 
578 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  37.5 
 
 
584 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.97 
 
 
572 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 
584 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  35.63 
 
 
581 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  37.15 
 
 
572 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.9 
 
 
577 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  35.6 
 
 
594 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  37.15 
 
 
600 aa  362  8e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.33 
 
 
576 aa  361  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>