More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2359 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  100 
 
 
586 aa  1194    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  60.1 
 
 
583 aa  698    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  59.39 
 
 
623 aa  770    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  65.3 
 
 
585 aa  786    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.15 
 
 
604 aa  616  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  52.45 
 
 
741 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  51.67 
 
 
755 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.08 
 
 
741 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  49.63 
 
 
741 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  49.82 
 
 
755 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  48.67 
 
 
742 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.87 
 
 
765 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  52.05 
 
 
765 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  50.56 
 
 
748 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  47.8 
 
 
577 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  50.77 
 
 
720 aa  509  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  46.01 
 
 
575 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  43.76 
 
 
574 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  46.35 
 
 
577 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  43.56 
 
 
584 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.08 
 
 
579 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.48 
 
 
719 aa  468  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  42.44 
 
 
575 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  43 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  42.76 
 
 
577 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.61 
 
 
577 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.44 
 
 
577 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  42.11 
 
 
582 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  45.09 
 
 
577 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  44.17 
 
 
577 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  43.29 
 
 
578 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  44.05 
 
 
577 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  44.09 
 
 
577 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
582 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  41.73 
 
 
577 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  43.18 
 
 
577 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  40.89 
 
 
577 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
581 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  41.13 
 
 
577 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  44.03 
 
 
581 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  42.77 
 
 
586 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
576 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.51 
 
 
579 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.57 
 
 
578 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  41.42 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.99 
 
 
587 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 
582 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.61 
 
 
654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
583 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  41.43 
 
 
595 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  41.92 
 
 
577 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  41.43 
 
 
595 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  41.43 
 
 
595 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  41.64 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  41.87 
 
 
577 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.07 
 
 
585 aa  398  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.68 
 
 
578 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.4 
 
 
578 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  38.97 
 
 
577 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  35.79 
 
 
578 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  38.1 
 
 
573 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  39.69 
 
 
580 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.5 
 
 
583 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 
594 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  38.91 
 
 
578 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  38.86 
 
 
577 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  36.88 
 
 
577 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  38.51 
 
 
577 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
593 aa  382  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
584 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  35.14 
 
 
583 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.15 
 
 
584 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  36.83 
 
 
578 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.67 
 
 
584 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.33 
 
 
584 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  39.89 
 
 
574 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 
584 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  36.63 
 
 
584 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.63 
 
 
584 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 
584 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.84 
 
 
652 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  39.69 
 
 
584 aa  360  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.15 
 
 
584 aa  359  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.15 
 
 
584 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.52 
 
 
579 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 
584 aa  355  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  36.38 
 
 
584 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  34.41 
 
 
581 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  36.96 
 
 
589 aa  345  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_963  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57 
 
 
290 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0350052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  37.06 
 
 
582 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  34.22 
 
 
578 aa  329  8e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  35.93 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  37.06 
 
 
589 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  34.74 
 
 
583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.69 
 
 
572 aa  327  5e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.67 
 
 
579 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  33.05 
 
 
594 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  37.06 
 
 
575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>