More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1366 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1366  ABC transporter related  100 
 
 
587 aa  1188    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  43.01 
 
 
652 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  41.27 
 
 
578 aa  481  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  42.31 
 
 
583 aa  475  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  43.32 
 
 
633 aa  464  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  40.91 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
581 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
576 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  41.94 
 
 
589 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.09 
 
 
580 aa  436  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.32 
 
 
576 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  42.46 
 
 
579 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  39.47 
 
 
578 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  37.52 
 
 
578 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  39.16 
 
 
600 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  34.84 
 
 
577 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  34.49 
 
 
577 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 
616 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
581 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  39.14 
 
 
741 aa  360  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  34.84 
 
 
583 aa  359  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  33.68 
 
 
578 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  34.04 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  35.24 
 
 
584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.24 
 
 
584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.07 
 
 
584 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 
584 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 
584 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  37.55 
 
 
742 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.18 
 
 
584 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.72 
 
 
584 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  32.1 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  34.16 
 
 
574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  33.69 
 
 
575 aa  337  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  34.93 
 
 
577 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  33.8 
 
 
594 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  32.35 
 
 
577 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  32.08 
 
 
586 aa  329  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  31.77 
 
 
577 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.57 
 
 
654 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  33.16 
 
 
584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
582 aa  326  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  32.76 
 
 
584 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.55 
 
 
579 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  32.51 
 
 
577 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  35.81 
 
 
755 aa  323  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  32.92 
 
 
575 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.09 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 
572 aa  322  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  33.33 
 
 
582 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  36.85 
 
 
755 aa  321  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  34.4 
 
 
577 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  32.5 
 
 
573 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  32.92 
 
 
577 aa  317  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 
582 aa  316  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  32.38 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  32.75 
 
 
594 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  36.79 
 
 
748 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.24 
 
 
587 aa  313  6.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
576 aa  313  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  32.27 
 
 
579 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  31.22 
 
 
595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  31.87 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  31.22 
 
 
595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  31.22 
 
 
595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  32.38 
 
 
577 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  33.21 
 
 
577 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  32.68 
 
 
577 aa  309  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  33.14 
 
 
741 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  32.51 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  32.03 
 
 
577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  34.98 
 
 
591 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  32.06 
 
 
575 aa  306  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  31.12 
 
 
581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  31.37 
 
 
577 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.52 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.89 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.81 
 
 
577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  30.9 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.98 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.4 
 
 
741 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  35.22 
 
 
720 aa  303  5.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.8 
 
 
765 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.99 
 
 
578 aa  302  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 
765 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  33.69 
 
 
572 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 
579 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
581 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 
593 aa  298  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.6 
 
 
578 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  30.88 
 
 
577 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.08 
 
 
581 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  31.79 
 
 
577 aa  298  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.87 
 
 
577 aa  296  6e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.61 
 
 
585 aa  296  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  30.84 
 
 
577 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>