More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2168 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  100 
 
 
572 aa  1170    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  41.04 
 
 
578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.18 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  38.88 
 
 
577 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  40.14 
 
 
577 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  37.54 
 
 
578 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
581 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  37.89 
 
 
575 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  35.85 
 
 
574 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  39.45 
 
 
575 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  37.15 
 
 
584 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  36.24 
 
 
583 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  35.35 
 
 
573 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  38.85 
 
 
741 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  36.81 
 
 
577 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  36.46 
 
 
577 aa  369  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
578 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
578 aa  353  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.1 
 
 
583 aa  352  8e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
576 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36.8 
 
 
594 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  35.78 
 
 
577 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  36.92 
 
 
755 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  34.72 
 
 
577 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 
593 aa  343  5.999999999999999e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  34.94 
 
 
580 aa  342  9e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  37.41 
 
 
742 aa  342  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  37.93 
 
 
748 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  36.27 
 
 
582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  34.95 
 
 
577 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  37.14 
 
 
755 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.57 
 
 
579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  35.49 
 
 
578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  35.04 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.04 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  34.62 
 
 
575 aa  336  7.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.88 
 
 
584 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  35.7 
 
 
584 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.7 
 
 
584 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.04 
 
 
584 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  35.9 
 
 
577 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 
654 aa  333  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 
579 aa  333  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 
578 aa  331  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.34 
 
 
584 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  35.66 
 
 
741 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  34.32 
 
 
577 aa  329  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 
587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.98 
 
 
584 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  34.2 
 
 
577 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 
577 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 
577 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  32.93 
 
 
582 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  32.74 
 
 
578 aa  324  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.02 
 
 
577 aa  323  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  34.74 
 
 
577 aa  323  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
584 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.6 
 
 
741 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  34.91 
 
 
577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  33.93 
 
 
589 aa  319  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  33.45 
 
 
586 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 
582 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
582 aa  317  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 
576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  33.28 
 
 
577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.48 
 
 
652 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  34.92 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  32.69 
 
 
586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  32.4 
 
 
574 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  33.04 
 
 
576 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  34.22 
 
 
577 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  32.86 
 
 
579 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  32.57 
 
 
600 aa  312  9e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
581 aa  312  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.04 
 
 
572 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  34.13 
 
 
578 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 
594 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0799  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.96 
 
 
579 aa  310  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.52 
 
 
585 aa  310  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  35.38 
 
 
577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3380  ABC transporter transmembrane region  31.99 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.16 
 
 
765 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.78 
 
 
765 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  33.86 
 
 
577 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.62 
 
 
578 aa  306  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  33.1 
 
 
581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  32.86 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  31.98 
 
 
581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 
719 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.76 
 
 
578 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  33.16 
 
 
585 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.57 
 
 
580 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.08 
 
 
623 aa  299  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  33.66 
 
 
720 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  32.29 
 
 
577 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 
601 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  34.54 
 
 
575 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  31.87 
 
 
595 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>