More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1891 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  100 
 
 		 598 aa  1200    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  71.19 
 
 		 592 aa  868    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  69.18 
 
 		 592 aa  805    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0561  multidrug ABC transporter  70.97 
 
 		 598 aa  849    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.793033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06171  putative multidrug efflux ABC transporter  71.26 
 
 		 598 aa  842    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  71.19 
 
 		 598 aa  863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  97.83 
 
 		 598 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  73.75 
 
 		 598 aa  899    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  71.33 
 
 		 597 aa  846    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  73.7 
 
 		 599 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  51.44 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  48.9 
 
 		 622 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  46.62 
 
 		 610 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  47.94 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  49.16 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  49.16 
 
 		 610 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  48.83 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  45.41 
 
 		 626 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 600 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  38.53 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  36.53 
 
 		 625 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.17 
 
 		 592 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.7 
 
 		 635 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  38.89 
 
 		 621 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  38.11 
 
 		 616 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.8 
 
 		 611 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 		 602 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.75 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.29 
 
 		 592 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.8 
 
 		 591 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.24 
 
 		 611 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  38.74 
 
 		 610 aa  349  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.29 
 
 		 614 aa  349  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.51 
 
 		 597 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.92 
 
 		 590 aa  347  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.12 
 
 		 608 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 608 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.14 
 
 		 588 aa  343  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 600 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.28 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34.69 
 
 		 613 aa  342  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34 
 
 		 617 aa  340  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.33 
 
 		 588 aa  340  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.56 
 
 		 614 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.78 
 
 		 598 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.39 
 
 		 600 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  34.24 
 
 		 603 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.28 
 
 		 598 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.33 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  38.15 
 
 		 603 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.8 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.11 
 
 		 598 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  37.3 
 
 		 602 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 642 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.43 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.33 
 
 		 594 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.94 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 620 aa  331  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.72 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.35 
 
 		 584 aa  329  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.16 
 
 		 592 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.56 
 
 		 594 aa  327  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.47 
 
 		 650 aa  327  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.67 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.67 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.78 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.23 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  35.56 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.39 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.94 
 
 		 600 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 592 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.78 
 
 		 637 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.54 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.54 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 		 605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.17 
 
 		 592 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  37.7 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.17 
 
 		 608 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.12 
 
 		 623 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.11 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.35 
 
 		 588 aa  317  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.18 
 
 		 598 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.27 
 
 		 587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.9 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  38.09 
 
 		 632 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.63 
 
 		 620 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.84 
 
 		 609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  33.44 
 
 		 625 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>