More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0561 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  70.97 
 
 
598 aa  856    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  64.98 
 
 
592 aa  811    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  64.03 
 
 
592 aa  748    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0561  multidrug ABC transporter  100 
 
 
598 aa  1204    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.793033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  68.17 
 
 
599 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06171  putative multidrug efflux ABC transporter  94.65 
 
 
598 aa  1111    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  88.13 
 
 
598 aa  1084    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  70.81 
 
 
598 aa  854    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  64.21 
 
 
598 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  93.65 
 
 
597 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  49.58 
 
 
598 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  49.66 
 
 
622 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  48.64 
 
 
610 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  48.03 
 
 
626 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  46.88 
 
 
626 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  47.3 
 
 
608 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  48.32 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  48.32 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.88 
 
 
602 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.49 
 
 
603 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  34.66 
 
 
625 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  37.9 
 
 
600 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
600 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.65 
 
 
588 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.7 
 
 
614 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.35 
 
 
622 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.64 
 
 
592 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.79 
 
 
616 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.02 
 
 
611 aa  353  7e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  37.9 
 
 
621 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.08 
 
 
587 aa  348  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.44 
 
 
635 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 
608 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.21 
 
 
614 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 
602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
607 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.36 
 
 
592 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.06 
 
 
597 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.49 
 
 
607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.67 
 
 
589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.91 
 
 
587 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  37.25 
 
 
650 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.28 
 
 
613 aa  337  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.1 
 
 
611 aa  337  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.01 
 
 
602 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.39 
 
 
608 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.99 
 
 
591 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  37.45 
 
 
603 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.68 
 
 
597 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.68 
 
 
597 aa  333  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
586 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.8 
 
 
587 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.98 
 
 
610 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
587 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.67 
 
 
587 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 
587 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 
587 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
587 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  34.35 
 
 
587 aa  330  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.29 
 
 
611 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.5 
 
 
594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.45 
 
 
590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.12 
 
 
602 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.47 
 
 
584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.88 
 
 
617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.82 
 
 
609 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  33.78 
 
 
594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.11 
 
 
587 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.29 
 
 
587 aa  326  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.67 
 
 
587 aa  326  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 
588 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.51 
 
 
620 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.4 
 
 
598 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.5 
 
 
617 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.28 
 
 
598 aa  323  6e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  35.17 
 
 
619 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.35 
 
 
594 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
642 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
600 aa  320  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.92 
 
 
600 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
575 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.56 
 
 
623 aa  319  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.55 
 
 
618 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.56 
 
 
618 aa  318  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.03 
 
 
556 aa  318  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.24 
 
 
592 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.08 
 
 
597 aa  316  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  33.45 
 
 
592 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  35.59 
 
 
629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  32.09 
 
 
585 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.89 
 
 
586 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
589 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  34.87 
 
 
645 aa  313  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  32.31 
 
 
603 aa  312  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.27 
 
 
609 aa  312  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 
604 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.75 
 
 
588 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>