More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06251 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  67.89 
 
 
599 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  71.19 
 
 
598 aa  851    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  64.98 
 
 
592 aa  799    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  63.68 
 
 
592 aa  734    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0561  multidrug ABC transporter  88.13 
 
 
598 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.793033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06171  putative multidrug efflux ABC transporter  88.29 
 
 
598 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
598 aa  1201    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  71.52 
 
 
598 aa  859    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  64.55 
 
 
598 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  88.46 
 
 
597 aa  1060    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  49.24 
 
 
598 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  50.08 
 
 
622 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  48.73 
 
 
610 aa  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  48.99 
 
 
610 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  48.99 
 
 
610 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  47.61 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  48.19 
 
 
608 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  45.63 
 
 
626 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
594 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  36.09 
 
 
625 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
600 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.53 
 
 
600 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.9 
 
 
602 aa  357  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  37.55 
 
 
616 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
622 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
603 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.02 
 
 
614 aa  348  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  36.2 
 
 
587 aa  348  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.47 
 
 
588 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  33.5 
 
 
611 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  34.63 
 
 
592 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  38.89 
 
 
621 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 
602 aa  342  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  37.65 
 
 
650 aa  340  5e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.29 
 
 
635 aa  339  7e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.4 
 
 
591 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  36.58 
 
 
608 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.96 
 
 
592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.94 
 
 
613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
607 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.68 
 
 
614 aa  337  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  34.18 
 
 
589 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.67 
 
 
611 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
586 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.12 
 
 
594 aa  330  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
592 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.75 
 
 
608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.79 
 
 
584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.07 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.96 
 
 
590 aa  327  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33 
 
 
597 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.52 
 
 
610 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.38 
 
 
602 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  36.42 
 
 
603 aa  323  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.61 
 
 
611 aa  323  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  35.19 
 
 
619 aa  323  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.2 
 
 
620 aa  321  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.8 
 
 
609 aa  319  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.42 
 
 
588 aa  319  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.67 
 
 
609 aa  318  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.4 
 
 
594 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.95 
 
 
598 aa  319  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
587 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
600 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
575 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.05 
 
 
597 aa  317  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.05 
 
 
597 aa  316  6e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.56 
 
 
594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.5 
 
 
609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  33.9 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  37.31 
 
 
586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 
587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.39 
 
 
587 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.27 
 
 
598 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 
598 aa  312  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33 
 
 
598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.09 
 
 
598 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.97 
 
 
617 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 
598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.59 
 
 
597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.78 
 
 
587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.78 
 
 
587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.78 
 
 
587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.96 
 
 
617 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.09 
 
 
598 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 
598 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
642 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 
598 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  32.66 
 
 
585 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 
618 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  31.69 
 
 
603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.11 
 
 
618 aa  309  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.59 
 
 
587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  33.62 
 
 
592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  33.62 
 
 
629 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33 
 
 
602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.05 
 
 
598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>