More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1573 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  100 
 
 		 590 aa  1205    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  48.73 
 
 		 600 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  48.7 
 
 		 608 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  47.83 
 
 		 600 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  50.29 
 
 		 597 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  38.28 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  38.1 
 
 		 597 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  40.56 
 
 		 604 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.56 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  39.29 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.56 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  39.57 
 
 		 593 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.19 
 
 		 589 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 618 aa  363  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  40.04 
 
 		 593 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 599 aa  359  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  39.96 
 
 		 595 aa  356  6.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  34.98 
 
 		 611 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  37.5 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  37.5 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  37.28 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.95 
 
 		 618 aa  353  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  37.94 
 
 		 596 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.11 
 
 		 602 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  36.56 
 
 		 580 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.73 
 
 		 627 aa  342  8e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.98 
 
 		 573 aa  340  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  37.23 
 
 		 598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 578 aa  340  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  38.07 
 
 		 606 aa  339  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.18 
 
 		 1091 aa  339  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  35.99 
 
 		 609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.37 
 
 		 1228 aa  336  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.24 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.65 
 
 		 581 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  36.07 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.13 
 
 		 592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  36.99 
 
 		 677 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  35.32 
 
 		 599 aa  327  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.07 
 
 		 583 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.66 
 
 		 580 aa  323  7e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.71 
 
 		 590 aa  320  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  36.71 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.23 
 
 		 573 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.21 
 
 		 595 aa  317  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  35.83 
 
 		 1194 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  34.23 
 
 		 573 aa  317  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 		 605 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  36.12 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.64 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.76 
 
 		 612 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.98 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 579 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.02 
 
 		 577 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  33.16 
 
 		 609 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.54 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.76 
 
 		 596 aa  304  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.9 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.02 
 
 		 576 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  35.91 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.83 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.15 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.38 
 
 		 581 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  33.89 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.2 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.52 
 
 		 577 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.52 
 
 		 577 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  35.41 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.36 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.58 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.05 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.5 
 
 		 607 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  33.94 
 
 		 593 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.83 
 
 		 588 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.19 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 		 581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.22 
 
 		 597 aa  287  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 581 aa  286  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.97 
 
 		 577 aa  286  8e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.66 
 
 		 576 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 		 859 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  32.63 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.39 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  32.75 
 
 		 596 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  31.01 
 
 		 597 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.55 
 
 		 603 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.85 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.18 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  32.96 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 586 aa  280  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 581 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>