More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0879 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  100 
 
 
592 aa  1196    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  46.21 
 
 
611 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  42.59 
 
 
604 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  43.32 
 
 
597 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
599 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  39.53 
 
 
677 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  39.46 
 
 
1228 aa  422  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  36.56 
 
 
596 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.34 
 
 
627 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.73 
 
 
589 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
590 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.17 
 
 
618 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  35.56 
 
 
609 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.12 
 
 
597 aa  391  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  38.3 
 
 
584 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.72 
 
 
573 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 
618 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  39.09 
 
 
593 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  38.32 
 
 
580 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  38.83 
 
 
587 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  36.99 
 
 
609 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.84 
 
 
602 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  38.83 
 
 
587 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.57 
 
 
595 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
588 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  39.41 
 
 
619 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.76 
 
 
590 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  36.59 
 
 
590 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.9 
 
 
593 aa  369  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  39.84 
 
 
606 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  36.98 
 
 
608 aa  363  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.44 
 
 
1091 aa  361  3e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.19 
 
 
578 aa  360  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 
581 aa  358  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.22 
 
 
600 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  36.15 
 
 
599 aa  355  8.999999999999999e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  39.48 
 
 
573 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  39.48 
 
 
573 aa  355  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.33 
 
 
598 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.34 
 
 
600 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.8 
 
 
596 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  36.4 
 
 
611 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.99 
 
 
576 aa  351  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  39.05 
 
 
608 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  34.91 
 
 
595 aa  346  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.15 
 
 
593 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  34.54 
 
 
584 aa  340  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.52 
 
 
581 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.61 
 
 
579 aa  337  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  36.07 
 
 
624 aa  336  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.13 
 
 
584 aa  335  9e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.46 
 
 
578 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 
583 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  35.04 
 
 
611 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.61 
 
 
580 aa  331  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
579 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  32.86 
 
 
606 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  34.05 
 
 
598 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.96 
 
 
583 aa  323  6e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.49 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 
612 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
581 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.71 
 
 
576 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  32.7 
 
 
577 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.48 
 
 
581 aa  316  7e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  37.52 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  37.52 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 
581 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  33.98 
 
 
603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.4 
 
 
577 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.4 
 
 
577 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.59 
 
 
587 aa  312  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.29 
 
 
592 aa  312  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
575 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.77 
 
 
581 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.94 
 
 
577 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 
579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.11 
 
 
1194 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.59 
 
 
1138 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
581 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.2 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.28 
 
 
593 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 
588 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.07 
 
 
581 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.19 
 
 
578 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  35.41 
 
 
596 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.33 
 
 
588 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  36.56 
 
 
597 aa  300  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.25 
 
 
597 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
619 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.95 
 
 
574 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.96 
 
 
574 aa  296  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  31.98 
 
 
596 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  34.82 
 
 
583 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.1 
 
 
607 aa  294  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  32.93 
 
 
579 aa  293  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.09 
 
 
574 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
859 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.69 
 
 
593 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>