More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3553 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.03 
 
 		 612 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  50.09 
 
 		 606 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  49.13 
 
 		 603 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 619 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  55.69 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  48.45 
 
 		 598 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  42.73 
 
 		 597 aa  418  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  43.23 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.11 
 
 		 605 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  41.99 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 859 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  40.68 
 
 		 600 aa  356  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 590 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.85 
 
 		 618 aa  355  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.07 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.4 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  36.13 
 
 		 596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.52 
 
 		 581 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.08 
 
 		 597 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 618 aa  343  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.53 
 
 		 593 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.63 
 
 		 589 aa  339  7e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.06 
 
 		 573 aa  333  8e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.01 
 
 		 604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  42.66 
 
 		 606 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.16 
 
 		 602 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  38.99 
 
 		 584 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  37.74 
 
 		 593 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  39.41 
 
 		 608 aa  323  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.62 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.62 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  37.19 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.5 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.49 
 
 		 595 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.86 
 
 		 576 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  37.54 
 
 		 677 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  34.21 
 
 		 619 aa  310  6.999999999999999e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.07 
 
 		 600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.3 
 
 		 590 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.27 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  32.3 
 
 		 590 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.59 
 
 		 609 aa  303  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  35.56 
 
 		 599 aa  303  8.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.36 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 627 aa  299  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.06 
 
 		 1091 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.98 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.44 
 
 		 1194 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  39.1 
 
 		 1228 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.57 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.72 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.25 
 
 		 595 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.6 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.6 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.16 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.43 
 
 		 583 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.2 
 
 		 582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.74 
 
 		 577 aa  283  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.65 
 
 		 577 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  34.74 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  35.9 
 
 		 565 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  36.24 
 
 		 596 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  33.82 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  34.21 
 
 		 611 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  40.23 
 
 		 597 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  35.42 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.97 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.51 
 
 		 568 aa  273  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.22 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.61 
 
 		 588 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.7 
 
 		 583 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.64 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  34.92 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  30.8 
 
 		 584 aa  263  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.09 
 
 		 584 aa  262  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  30.31 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 		 581 aa  261  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 		 574 aa  260  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  37.81 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.6 
 
 		 593 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  34.26 
 
 		 593 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.83 
 
 		 1138 aa  256  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.02 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.27 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  37.16 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.54 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  29.7 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 		 571 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  31.71 
 
 		 596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.92 
 
 		 593 aa  253  7e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>