More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1035 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  100 
 
 		 619 aa  1192    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  50.17 
 
 		 611 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  46.14 
 
 		 606 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  47.48 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.59 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  47.36 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  48.29 
 
 		 603 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.71 
 
 		 605 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  53.39 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  39.68 
 
 		 597 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  42.59 
 
 		 624 aa  365  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  40.66 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.93 
 
 		 611 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.26 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  37.17 
 
 		 608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.32 
 
 		 592 aa  336  7e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 859 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.87 
 
 		 589 aa  329  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.29 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.29 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.22 
 
 		 597 aa  326  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.58 
 
 		 595 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.19 
 
 		 597 aa  323  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.21 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  36.26 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.05 
 
 		 596 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.11 
 
 		 627 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  37.43 
 
 		 584 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  42.39 
 
 		 598 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 599 aa  316  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.13 
 
 		 619 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.83 
 
 		 580 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 590 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.71 
 
 		 609 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 618 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.67 
 
 		 618 aa  306  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.83 
 
 		 602 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  40.4 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.29 
 
 		 576 aa  303  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  40.15 
 
 		 577 aa  303  8.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.06 
 
 		 608 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  33.45 
 
 		 590 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  40.6 
 
 		 1228 aa  296  9e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.04 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.78 
 
 		 576 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.91 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.29 
 
 		 622 aa  293  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.45 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  36.19 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.12 
 
 		 581 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.57 
 
 		 600 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  38.63 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  36.49 
 
 		 677 aa  290  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 581 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.84 
 
 		 1091 aa  289  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.13 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.23 
 
 		 596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.82 
 
 		 596 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.17 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.66 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.43 
 
 		 565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 		 663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.77 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.67 
 
 		 579 aa  283  7.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  40.69 
 
 		 620 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.59 
 
 		 1194 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  40.84 
 
 		 596 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.62 
 
 		 627 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 		 593 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 572 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 579 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  38.9 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  30.05 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  29.49 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.68 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.33 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  29.67 
 
 		 573 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  38.46 
 
 		 654 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  39.37 
 
 		 659 aa  277  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.08 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.96 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  38.42 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.85 
 
 		 702 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.54 
 
 		 612 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.28 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.2 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  38.11 
 
 		 592 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33 
 
 		 631 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  34.37 
 
 		 612 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.62 
 
 		 592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.59 
 
 		 607 aa  270  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>